Job Description P27550 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:44:02 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 445 % Identity 20% Template c3iplB_ PDB info PDB header:ligase Chain: B: PDB Molecule:2-succinylbenzoate--coa ligase; PDBTitle: crystal structure of o-succinylbenzoic acid-coa ligase from2 staphylococcus aureus subsp. aureus mu50 Resolution 2.30 Å

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		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	N	C	L	D	R	H	L	Q	E	N	G	D	R	T	A	I	I	W	E	G	D	D	A	S	Q	S	K	H	I	S	Y	K	E	L	H	R	D	V	C	R	F	A	N	T	L	L	E	L	G	I	K	K	G	D	V	V	A	I	Y	M	P	M	V	P	E	A	A	V	A	M	L	A	C	A	R	I	G	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		L	D	F	W	L	Y	K	Q	A	Q	Q	N	G	H	H	I	A	I	T	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	E	S	Y	T	Y	Q	N	L	Y	C	E	A	S	L	L	A	K	R	L	.	.	.	K	A	Y	Q	Q	S	R	V	G	L	Y	I	D	N	S	I	Q	S	I	I	L	I	H	A	C	W	L	A	N	I
Template Known Secondary structure													S	T	T	S					.	.	.	.	.	.		S	S																				.	.	.		T	T			S								S	S													T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.							20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.				.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	H	S	V	I	F	G	G	F	S	P	E	A	V	A	G	R	I	I	D	S	N	S	R	L	V	I	T	S	D	E	G	V	R	A	G	R	S	I	P	L	K	K	N	V	D	D	A	L	K	N	P	N	V	T	S	V	E	H	V	V	V	L	K	R	T	G	G	K	I	D	W	Q	E	G	R	D	L	W	W
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	I	A	M	I	N	T	R	L	T	P	N	E	M	T	N	Q	M	R	S	I	D	V	Q	L	I	F	C	T	L	P	L	E	L	R	G	F	Q	I	V	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T													T	T							S	S					T	T	S					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	D	L	V	E	Q	A	S	D	Q	H	Q	A	E	E	M	N	A	E	D	P	L	F	I	L	Y	T	S	G	S	T	G	K	P	K	G	V	L	H	T	T	G	G	Y	L	V	Y	A	A	L	T	F	K	Y	V	F	D	Y	H	P	G	D	I	Y	W	C	T	A	D	V	G	W	V	T	G	H	S	Y	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.																																																		.
Template Conservation		.																																																		.
Template Sequence		.	D	D	I	E	F	S	P	S	N	I	L	N	T	S	F	N	L	D	D	I	A	S	I	M	F	T	S	G	T	T	G	P	Q	K	A	V	P	Q	T	F	R	N	H	Y	A	S	A	I	G	.	C	K	E	S	L	G	F	D	R	D	T	N	W	L	S	V	L	P	I	Y	H	I	S	G	L	S	V	L	L
Template Known Secondary structure		.											T						T	T	S									S	S	S	S																			.					T				T	T							S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.																																																		.
Template SS confidence
			114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	P	L	A	C	G	A	T	T	L	M	F	E	G	V	P	N	W	P	T	P	A	R	M	A	Q	V	V	D	K	H	Q	V	N	I	L	Y	T	A	P	T	A	I	R	A	L	M	A	E	G	D	K	A	I	E	G	T	D	R	S	S	L	R	I	L	G	S	V	G	E	P	I	N	P	E	A	W	E	W
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	V	I	E	G	F	T	V	R	I	V	D	K	.	.	.	.	.	F	N	A	E	Q	I	L	T	M	I	K	N	E	R	I	T	H	I	S	L	V	P	Q	T	L	N	W	L	M	Q	Q	.	.	.	.	.	G	L	H	E	P	Y	N	L	Q	K	I	L	L	G	G	A	K	L	S	A	T	M	I	E	T
Template Known Secondary structure							T							S	S	.	.	.	.	.													T	T																		.	.	.	.	.	T			S		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.						.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.						.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	K	K	I	G	N	E	K	C	P	V	V	D	T	W	W	Q	T	E	T	G	G	F	M	I	T	P	L	P	G	A	T	E	L	K	A	G	S	A	T	R	P	F	F	G	V	Q	P	A	L	V	D	N	E	G	N	P	L	E	G	A	T	E	G	S	L	V	I	T	D	S	W	P	G	Q	A	R	T	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.																																															.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation						.	.	.	.																																															.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		A	L	Q	Y	.	.	.	.	N	L	P	I	Y	N	S	F	G	M	T	E	T	C	S	Q	F	L	T	A	T	P	E	M	L	H	A	R	P	D	T	V	G	M	P	S	A	N	V	D	V	K	I	K	N	P	.	.	.	.	.	N	K	E	G	H	G	E	L	M	I	K	G	A	N	.	.	V	M	N	G	Y
Template Known Secondary structure					T	.	.	.	.	T										G	G	G	T															T	T							T	T							S		.	.	.	.	.		S	S	S								S	T	T	.	.	S		S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.																																															.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.						.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.			.	.	.	.	360
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	D	H	E	R	F	E	Q	T	Y	F	S	T	F	K	N	M	Y	F	S	G	D	G	A	R	R	D	E	D	G	Y	Y	W	I	T	G	R	V	D	D	V	L	N	V	S	G	H	R	L	G	T	A	E	I	E	S	A	L	V	A	H	P	K	I	A	E	A	A	V	V	G	I	P	H	N	I	K	G	Q
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	P	T	D	L	T	G	T	F	E	.	.	.	.	N	G	Y	F	N	T	G	D	I	A	E	I	D	H	E	G	Y	V	M	I	Y	D	R	R	K	D	L	I	I	S	G	G	E	N	I	Y	P	Y	Q	I	E	T	V	A	K	Q	F	P	G	I	S	D	A	V	C	V	G	H	P	D	D	T	W	G	Q
Template Known Secondary structure		S	B		S								.	.	.	.	T	T												T	T											S					T	T															S	T	T												S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.					.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	Y	A	Y	V	T	L	N	H	G	E	E	P	S	P	E	L	Y	A	E	V	R	N	W	V	R	K	E	I	G	P	L	A	T	P	D	V	L	H	W	T	D	S
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.
Template Sequence		V	P	K	L	Y	F	V	S	E	S	D	I	S	.	.	.	.	.	K	A	Q	L	I	A	Y	L	S	K	H	L	A	K	Y	K	V	P	K	H	F	E	K	V	D	T
Template Known Secondary structure										S	S				.	.	.	.	.												S		T	T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.						450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.