Job Description P09053 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:01:50 GMT 2012 Rank 62 Aligned Residues 353 % Identity 16% Template c3f6tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aspartate aminotransferase (e.c. 2.6.1.1)2 (yp_194538.1) from lactobacillus acidophilus ncfm at 2.15 a3 resolution Resolution 2.15 Å

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		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.				90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.
Query Sequence		P	A	Q	I	P	E	M	Q	D	Y	F	Q	T	L	L	T	D	M	L	E	S	G	K	A	T	D	A	L	C	N	Y	D	G	P	Q	G	K	T	E	L	L	T	L	L	A	G	M	L	R	E	.	.	.	K	L	G	W	D	I	E	P	Q	N	I	A	L	T	N	G	S	Q	S	A	F	F	Y	L	F	N	L
Query Conservation																																																				.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	E	L	G	L	N	R	D	K	V	V	A	E	W	V	N	G	A	V	A	N	N	.	.	.	.	.	.	Y	P	V	P	D	R	C	L	V	N	T	E	K	I	I	N	Y	F	L	Q	E	L	S	Y	K	D	A	N	L	A	E	Q	T	D	L	F	P	T	E	G	G	T	A	A	I	V	Y	A	F	H	S
Template Known Secondary structure				T	T																	T		S	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S																		T	T	T				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.							.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		117						.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.
Query Sequence		F	.	.	.	.	.	A	G	R	R	A	D	G	R	V	K	K	V	L	F	P	L	A	P	E	Y	I	G	Y	A	D	A	G	L	E	E	D	L	F	V	S	A	R	P	N	I	E	L	L	P	E	G	Q	F	K	Y	H	V	D	F	E	H	L	H	I	G	E	E	T	G	M	I	C	V	S	R	P	T	N	P
Query Conservation			.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.																											.
Template Sequence		L	A	E	N	H	L	L	K	K	G	D	K	.	.	.	.	.	.	I	A	I	N	E	P	I	F	T	P	Y	L	R	I	P	E	L	K	D	Y	E	L	V	E	V	D	.	L	H	S	Y	E	K	N	D	W	E	I	E	P	N	E	I	E	K	L	K	D	P	S	I	K	A	L	I	V	V	N	P	T	N	P
Template Known Secondary structure					T	T	S	S		T	T			.	.	.	.	.	.					S	S							T	S	G	G	G	G	G	S							.					T	T	T	T	S											S		T	T								S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.																											.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.							.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.		.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.																																																									.	.	.
Query SS confidence																						.																																																									.	.	.
Query Sequence		T	G	N	V	I	T	D	E	E	L	L	K	L	D	A	L	A	N	Q	H	.	G	I	P	L	V	I	D	N	A	Y	G	V	P	F	P	G	I	I	F	S	E	A	R	P	L	W	N	P	N	I	V	L	C	M	S	L	S	K	L	G	L	P	G	S	R	C	G	I	I	I	A	N	E	K	I	I	.	.	.
Query Conservation																						.																																																									.	.	.
Alig confidence																						.																	.	.																																							.	.	.
Template Conservation																																							.	.
Template Sequence		T	S	K	E	F	D	T	N	A	L	N	A	I	K	Q	A	V	E	K	N	P	K	L	X	I	I	S	D	E	V	Y	G	A	F	V	P	N	.	.	F	K	S	I	Y	S	V	V	P	Y	N	T	X	L	V	Y	S	Y	S	L	F	G	C	T	G	W	R	L	G	V	I	A	L	N	E	K	N	V	F	D	D
Template Known Secondary structure		T		B																		T	T								T	T	G	G	G	S	T	T	.	.								S	G	G	G											S		G	G	G									S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.			.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
																																				268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	I	T	N	M	N	G	I	I	S	L	A	P	G	G	I	G	P	A	M	M	C	E	M	I	K	R	N	D	L	L	R	L	S	E	T	V	I	K	P	F	Y	Y	Q	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	A	H	L	D	K	V	E	L	R	Q	L	H	K	R	Y	S	S	V	V	L	D	P	D	K	X	K	F	I	D	R	L	C	A	D	S	R	S	I	G	L	Y	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	I	X	E	A	L	F	S	X	T	H	L	L	T	S	T	N	G	G	S	D	D	P	Y	I	D	I	A
Template Known Secondary structure					T	S														T	T		S		G	G	G												T	T	T	T	T	G	G	G		S																		T	T		B	G	G	G	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Q	E	T	I	A	I	I	R	R	Y	L	P	.	.	E	N	R	C	L	I	H	K	P	E	G	A	I	F	L	W	L	W	F	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	I	T	T	K	Q	L	Y	Q	R	L	K	A	R	G	V	L	M	V	P	G	H	N	F	F	P	G
Query Conservation															.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		R	K	L	V	S	E	R	Y	D	Q	L	H	D	A	X	Q	A	P	K	D	E	T	D	T	N	T	H	Y	Y	S	L	I	D	I	Y	R	L	A	E	K	I	Y	G	K	E	F	R	D	Y	L	T	N	N	F	E	Q	V	D	F	L	L	K	L	A	E	K	N	G	V	V	L	V	D	G	V	G	F	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T						S	T	T	B			S																																							T	T	S	S	S		T	T				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.		.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		L	D	K	P	W	P	H	T	H	Q	C	M	R	M	N	Y	V	P	.	E	P	E	K	I	E	A	G	V	K	I	L	A	E	E	I	E	R	A	W	A	E
Query Conservation																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	G	A	K	P	G	E	L	R	V	S	Q	A	N	L	P	T	E	D	Y	A	L	I	G	K	Q	V	L	E	L	L	K	E	Y	Y	E	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.		S	S	T	T						S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.