Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 76 Aligned Residues 349 % Identity 17% Template d2bhua3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.1

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		40	.	.	.	.					.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.																																																		.	.
Query SS confidence							.	.	.	.																																																		.	.
Query Sequence		R	K	K	H	W	.	.	.	.	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W
Query Conservation							.	.	.	.																																																		.	.
Alig confidence							.	.	.	.																		.	.																															.	.
Template Conservation																												.	.
Template Sequence		T	D	A	D	W	H	G	I	K	L	A	D	C	V	F	Y	E	V	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	G	T	Y	R	A	A	A	E	K	L	P	Y	L	K	E	L	G	V	T	A	I	Q	V	M	P	L	A	A	F	D	G	Q	R	G	W	G	Y	D	G	A	A	F	Y	A	P	Y	A	P	Y	G	R	P
Template Known Secondary structure				T	T						G	G	G												S	S	S	.	.		S							T								T													S	S	S				S	T	T									G	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140			.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	L	M	A	L	V	D	A	A	H	R	L	G	L	G	V	F	L	D	V	V	Y	N	H	F	G	P	S	G	N	Y	L	S	S	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	P	S	Y	F	T	D	R	F	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T										S				S	S	S						.	.	.	.	.	.	.			G	G	G								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.								.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V
Query Conservation																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																										.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	A	W	G	M	G	L	D	Y	A	E	P	H	M	R	R	Y	V	T	G	N	A	R	M	W	L	R	D	Y	H	F	D	G	L	R	L	D	A	T	P	Y	M	T	D	D	S	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	I	L	T	E	L	A	Q	E	I	H	E	L	G	G	T	H	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S	S	S					T	T	S																					S					T	T	G	G	G					S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.										.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.											310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	A	E	D	H	R	N	L	P	D	L	V	T	.	.	.	.	.	V	N	H	L	D	G	I	W	T	D	D	F	H	H	E	T	R	V	T	L	T	G	E	Q	E	G	Y	Y	A	G	Y	R	G	G	A	E	A	L	A	Y	T	I	R	R	G	W	R	Y	E	G	Q	F	W	A	V	K	G	E	E	H	E
Template Known Secondary structure							S	S			T					.	.	.	.	.	T	T			S					T															S	G	G	G	G	G				S											S	S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.						.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
										326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	H	P	S	D	A	L	E	A	P	N	F	V	Y	C	I	Q	N	H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	G	N	R	P	L	G	E	R	L	H	Q	S
Template Known Secondary structure							T	T			G	G	G					S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	S	T	T				G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440																.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	V	T	L	H	E	Y	R	G	A	A	A	L	L	L	T	L	P	M	T	P	L	L	F	Q	G	Q	E	W	A	A	S	T	P	F	Q	F	F	S	D	H	A	G	E	L	G	Q	A	V	S	E	G	R	K	K	E	F	D	V	P	D	P	Q	A	E	Q	T	F	L	N	S	K	L	N	W	A	E	R	E
Template Known Secondary structure		T	T																S	S	S						T	T	G	G	G	T		S	S																													T	T	S						T	T	S			S	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	G	E	H	A	R	T	L	R	L	Y	R	D	L	L	R	L	R	R	E	D	P	V	L	H	N
Template Known Secondary structure		S																					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.