Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 399 % Identity 20% Template d1uoka2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.				.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.																															.
Query SS confidence																									.	.	.																															.
Query Sequence		K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I
Query Conservation																									.	.	.																															.
Alig confidence																									.	.	.																															.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	Q	W	W	K	E	S	V	V	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	S	N	G	D	G	I	G	D	L	R	G	I	I	S	K	L	D	Y	L	K	E	L	G	I	D	V	I	W	L	S	P	V	Y	E	S	P	N	D	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	C	K	I	M	N	E	F	G	T	M	E	D	W
Template Known Secondary structure																G	G	G	T			S	S	S	S	S	S								T	T								T															T	T	T	T	S	S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		117	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence										.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W
Query Conservation										.	.	.	.	.																								.
Alig confidence										.	.	.	.	.																								.																.
Template Conservation																																																						.
Template Sequence		D	E	L	L	H	E	M	H	E	R	N	M	K	L	M	M	D	L	V	V	N	H	T	S	D	E	H	N	W	F	I	E	S	R	K	S	K	D	N	K	Y	R	D	Y	Y	I	W	R	P	G	K	E	.	G	K	E	P	N	N	W	G	A	A	F	S	G	S	A	W	Q	Y	D	E	M	T	D	E	Y	Y	L
Template Known Secondary structure											T	T										S	B			T	T	S							T	T		T	T		T	T	G	G	G	B						S	S	.	S	S		S	S		B	B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.																240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	F	S	K	K	Q	P	D	L	N	W	D	N	E	K	V	R	Q	D	V	Y	E	M	M	K	F	W	L	E	K	G	I	D	G	F	R	M	D	V	I	N	F	I	S	K	E	E	G	L	P	T	V	E	T	E	E	E	G	Y	V	S	G	H	K	H	F	M	N	G	P	N	I	H	K	Y	L	H	E	M
Template Known Secondary structure			S	S		T	T	S		B	B		T	T	S																	T	T							T	T	G	G	G	S				T	T									S	S		B			G	G	G	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310							.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	.	.	.	.	.	.	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	E	V	L	S	H	Y	D	I	M	T	V	G	E	M	P	G	V	T	T	E	E	A	K	L	Y	T	G	E	E	R	K	E	L	Q	M	V	F	Q	F	E	H	M	D	L	D	S	G	E	G	G	K	W	D	V	K	P	C	S	L	L	T	L	K	E	N	L	T	K	W	Q	K	A	L	E	H	T	G	W
Template Known Secondary structure					T	G	G	G	S									T	T												G	G	G		S		S						G	G	G	S	T	T			T	T																								T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	L	Y	W	N	N	H	D	Q	P	R	V	V	S	R	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	G	M	Y	R	I	E	S	A	K	M	L	A
Template Known Secondary structure						S			T	T	S							T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	L	H	M	M	K	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	V	R	F	E	S	I	D	E	Y	R	D	I	E	T	L	N	M	Y	K	E	K	V	M	E	R	G	E	D	I	E	K	V	M	Q	S	I	Y	I	K	G	R	D	N	A	R	T	P	M	Q	W	D	D	Q	N	H	A	G	F
Template Known Secondary structure						T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G																T	S																G	G	G	G	T	S						S	S	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	T	G	E	P	W	I	T	V	N	P	N	Y	K	E	I	N	V	K	Q	A	I	Q	N	K	D	S	I	F	Y	Y	Y	K	K	L	I	E	L	R	K	N	N	E	I	V	V	Y
Template Known Secondary structure			S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.