Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 98 Aligned Residues 325 % Identity 14% Template d1ua7a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.21

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		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.												.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.											.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	I	.	K	S	G	T	I	L	H	A	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	F	N	T	L	K	H	N	M	K	D	I	H	D	A	G	Y	T	A	I	Q	T	S	P	I	N	Q	V	K	E	G	N	Q	G	D	K	S	M	S	N	W	Y	W	L	Y	Q	P	T	S	Y	Q	I	G	N	R	Y	L
Template Known Secondary structure				T	.	T	T	S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	B								T							T	T		S													T	G	G	G			B	G	G	G	G	G	G	G	G										T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.		.	.	.	10	.	.	.	.	.	.									.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S
Query Conservation																.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																							.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	E	Q	E	F	K	E	M	C	A	A	A	E	E	Y	G	I	K	V	I	V	D	A	V	I	N	H	T	T	F	D	Y	A	A	I	S	N	E	V	K	.	.	.	S	I	P	N	W	T	H	G	N	T	Q	I	K	N	W	S	D	R	W	D	V	T	Q	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T	T										S	B			S		T	T	T	S						.	.	.	T	S	T	T							B				T	T								S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.				.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	G	L	Y	D	W	N	T	Q	N	T	Q	V	Q	S	Y	L	K	R	F	L	E	R	A	L	N	D	G	A	D	G	F	R	F	D	A	A	K	H	I	E	L	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	S	Y	G	S	Q	F	W	P	N	I	T	N	.	T	S	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T	B					T	T	S																	T	T							T	T	G	G	G	S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G			S						T		.	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
										141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.										.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.		200	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	Q	Y	G	E	I	L	Q	D	S	A	S	R	D	A	A	Y	A	N	Y	M	D	V	T	A	S	N	Y	G	H	S	I	R	S	A	L	K	N	R	N	L	G	.	.	.	.	.	.	V	S	N	I	S	H	Y	A	S	D	V	S	A	D	K	L	V	T	W	V	E	S	H	D	T	Y	A	N	D	D	E
Template Known Secondary structure		S									S	T	T								T	T	S																		T				.	.	.	.	.	.					S	S		S	S	S	S		G	G	G					S	S							S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.							.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	T	W	M	S	D	D	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	G	W	A	V	I	A	S	R	S	G	S	T	P	L	F	F	S	R	P
Template Known Secondary structure		S	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	G	G	.	.	.	.	N	G	V	R	F	P	G	K	S	Q	I	G	D	R	G	S	A	L	F	E	D	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	A	V	N	R	F	H	N	V
Template Known Secondary structure		T	T		B	.	.	.	.	T	T	B	S			S	S		B	T	B	S				G	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.					.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.