Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 55 Aligned Residues 346 % Identity 21% Template d1ea9c3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 3.2

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		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	D	D	G
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	P	P	A	W	V	K	D	A	I	F	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	T	R	N	D	P	E	G	T	L	P	W	G	S	A	D	P	T	P	S	C	F	F	G	G	D	L	Q	G	V	I	D	H	L	D	H	L	S	K	L	G	V	N	A	V	Y	F	T	P	L	F	K	A	T	T	N	H	K
Template Known Secondary structure					T												S	T	T	S					S		S		S	S			S				S	S	S				S	S												T								T		S								S	S		S	S	S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.			.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P
Query Conservation																													.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																								.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	T	E	D	Y	F	Q	I	D	P	Q	F	G	D	K	D	T	L	K	K	L	V	D	L	C	H	E	R	G	I	R	V	L	L	D	A	V	F	N	H	S	G	R	T	F	P	P	F	V	D	V	L	K	N	G	E	K	S	K	Y	K	D	W	F	H	I	R	S	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S		S		T	T				T	T	T														T	T	T	T										S	B			T	T	T								T	T	T	T	T		T	T	T	T	S	S		B		S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H
Query Conservation																																																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	V	V	D	G	I	P	T	Y	D	T	F	A	F	E	P	L	M	P	K	L	N	T	E	H	P	D	V	K	E	Y	L	L	K	A	A	E	Y	W	I	R	E	T	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S			S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B			T	T	S																					S					T	T		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330														.	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.
Query SS confidence																																																														.	.
Query Sequence		L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N
Query Conservation																																																														.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	F	W	R	E	F	R	R	V	V	K	Q	A	N	P	D	A	Y	I	L	G	E	V	W	H	E	S	S	I	W	L	E	.	.	.	.	.	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	F	T	N	A	V	L	D	F	F	I	H	Q	I	A	D	A	E	K	F	S	F	M	L	G	K	Q	L	A	G	Y	P	R
Template Known Secondary structure																T	T									S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	T	T	S		S			B												T	T	S			S												T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.						.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		328	.	330				.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.
Query SS confidence					.	.	.
Query Sequence		T	T	W	.	.	.	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R
Query Conservation					.	.	.
Alig confidence					.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	S	E	V	M	F	N	L	L	D	S	H	D	T	A	R	L	L	T	Q	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	K	R	K
Template Known Secondary structure						T					S			T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430																																																					.	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	L	A	V	L	F	Q	F	T	Y	F	G	T	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	H	D	P	G	C	R	K	C	M	E	W	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	H	D	K	D	L	F	A	F	Y	Q	T	V	I	R	L	R	Q	A	H	A
Template Known Secondary structure										T	T	S	S	S						S	S		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.			S					T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S																				S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.										.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.									.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
		485	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	H	P	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	L	R	T	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		499	500	.	.	.