Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 356 % Identity 19% Template d1cyga4 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.50

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	.	.	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	V	N	F	T	S	D	V	V	Y	Q	I	V	V	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	S	G	A	L	F	S	S	G	C	T	N	L	R	K	Y	C	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	D	M	G	V	T	A	I	W	I	S	Q	P	V	E	N	V	F	S	V	M
Template Known Secondary structure			T	T			T	T								G	G	G	T			S		G	G	G				G	G	G	B		G	G	G		S	T	T	S	B														T	S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
							92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	W	S	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	A	S	G	S	A	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	K	P	N	P	F	F	G	T	L	S	D	F	Q	R	L	V	D	A	A	H	A	K	G	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	N	P	S	Y	M	E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T	L	L	G	G	Y	T
Template Known Secondary structure		S	S	S	S				S	T	T	S		S									T	T	T																T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T					T	T						S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	A	N	M	Y	F	H	H	N	G	G	T	T	F	S	S	L	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	H	Q	N	P	V	I	D	R	Y	L	K	D	A	V	K	M	W	I	D	M	G	I	D	G	I	R	M	D	A	V	K	H	M	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		T	T			B			S		B				S	S					.	.	.	.	.	.	.		S	S	B	S	T	T				B		T	T	S																T	T	T							S		G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.								.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.				310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.
Query Sequence		C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A
Query Conservation																																																																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	F	G	W	Q	K	S	L	M	D	E	I	D	N	Y	R	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	S	E	N	E	V	D	A	N	N	H	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	G	Q	K	L	R	Q	V	L	R	N	N	S	D	N	W	Y	G	F	N	Q	M	I	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		S																										T	T													S	S				B													T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	A	S	A	Y	D	E	V	L	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	I	D
Template Known Secondary structure								T	T	G	G	G					S			T	T	S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	330	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	D	P	R	K	V	D	M	A	L	A	V	L	L	T	S	R	G	V	P	N	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	G	D	P	N	N	R	K	M	M	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	K	N	T	R	A	Y	Q	V	I	Q	K	L	S	S
Template Known Secondary structure		T			T													S	S	S						T	T	G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	G	G	G						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S		S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.										.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.											.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	R	S	H	N	E	F	H	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	R	R	N	N	P	A	L	A	Y
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.