Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 447 % Identity 15% Template c3zt5D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:putative glucanohydrolase pep1a; PDBTitle: glge isoform 1 from streptomyces coelicolor with maltose2 bound Resolution 2.09 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50															.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query Sequence		K	Q	K	I	T	D	Y	L	D	E	I	Y	G	G	T	F	T	A	T	H	L	Q	K	L	V	T	R	L	E	S	A	K	R	L	I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	.	.	N	D	L	K	P
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	E	L	L	A	A	V	D	A	L	R	D	E	S	R	P	A	A	S	R	L	A	A	A	L	T	P	Q	V	D	A	V	L	A	R	H	P	L	R	D	L	V	T	S	S	D	P	L	P	L	L	V	E	R	E	R	A	L	Y	G	A	W	Y	E	F	F	P	R	S	E	G	T	P	H	T	P	H	G	T
Template Known Secondary structure															T	T	S								T	T	S	S										S																															G	G	G	S			S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	T	A	A	R	R	L	P	A	I	A	A	M	G	F	D	V	V	Y	L	P	P	I	H	P	I	G	T	T	H	R	K	G	R	N	N	T	L	S	A	T	G	D	D	V	G	V	P	W	A	I	G	S	P	E	G	G	H	D	S	I	H	P	A	L	G	T	L	D	D	F	D	H	F	V	T	E	A	G
Template Known Secondary structure						G	G	G							T	T										S		B			T	T			B	G	G	G	B	S	S			T	T					T	T	S	B		B	T	T	B		T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
							125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.												.								.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.								.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	G	L	E	I	A	L	D	F	A	L	Q	C	S	P	.	D	H	P	W	V	H	K	.	.	.	.	.	.	.	H	P	E	W	F	H	H	R	P	D	G	T	I	A	H	A	E	N	P	P	K	K	Y	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	P	I	A
Template Known Secondary structure			T	T													T	.	T	S						.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	S				T	T	S								T	T				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.								.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.								.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				360	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	D	A	D	P	D	G	L	A	T	E	T	V	R	I	L	R	H	W	M	D	H	G	V	R	I	F	R	V	D	N	P	H	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	A	F	W	E	R	V	I	A	D	I	N	G	T	D	P	D	V	I	F	L	A	E	A	F	T	R	P	A	M	M
Template Known Secondary structure			S	S																		T	T	T							S		G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.														400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	L	A	Q	.	.	.	I	G	F	Q	Q	S	Y	T	Y	F	T	W	R	N	T	K	Q	E	L	T	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	L	T	E	L	S	G	E	A	A	S	Y	M	R	P	N	F	F	A	N	T	P	D	I	L	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							.	.	.		T		S					S	G	G	G			S						.	.	.	.	.	.	.								T	G	G	G	G	T							S		B	T	T	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.				.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.								.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	.	A	G	V	E	K
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	Q	H	G	G	R	P	A	F	E	V	R	A	V	L	A	A	T	L	S	P	T	W	G	I	Y	S	G	Y	E	L	C	E	N	T	P	L	R	E	G	S	E	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						S						T	T	T	T	T	T				B	S	S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																						485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490		.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.
Query SS confidence																																																						.
Query Sequence		L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	.	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L
Query Conservation																																																						.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.																															.																			.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Sequence		Y	L	D	S	E	K	Y	Q	L	K	P	R	D	W	T	.	.	.	.	.	.	.	R	A	A	R	E	G	T	T	I	A	P	L	V	T	R	L	N	T	I	R	R	E	N	P	A	L	R	Q	L	R	D	L	H	F	H	P	T	D	K	E	E	V	I	A	Y	S	K	R	Q	.	G	S	N	T	V	L	V	V
Template Known Secondary structure		B	T	T		T	T	S	S								.	.	.	.	.	.	.						T																		G	G	G	G		S	S							B	S		T	T									.	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template SS confidence
		529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.								.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.		.	.	.	.	.	.	.	600
		518	.	520	.				.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.											.	.	.	.	.	540	.	.	.				.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.												.	.
Query SS confidence						.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.												.	.
Query Sequence		F	N	V	S	.	.	.	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	N	L	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	L	I	S	E	V	D	I	.	.	.	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	.	.	V	M	W	I	K
Query Conservation						.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.												.	.
Alig confidence						.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	L	D	P	R	H	T	Q	E	A	T	V	S	L	D	M	P	Q	L	G	L	D	W	H	E	S	V	P	V	R	D	E	L	T	G	E	T	Y	H	W	G	R	A	N	Y	V	R	L	E	P	G	R	T	P	A	H	V	C	T
Template Known Secondary structure						S	S	S										T	G	G	G	T			T	T								T	T	T	T							S								T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		601	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660