Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 432 % Identity 18% Template c3k1dA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:1,4-alpha-glucan-branching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen branching enzyme synonym: 1,4-alpha-d-2 glucan:1,4-alpha-d-glucan 6-glucosyl-transferase from mycobacterium3 tuberculosis h37rv Resolution 2.33 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																																									.																					.	.
Query SS confidence																																									.																					.	.
Query Sequence		L	I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	.	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G
Query Conservation																																									.																					.	.
Alig confidence																														.	.										.																					.	.
Template Conservation																														.	.
Template Sequence		M	A	G	R	A	L	R	N	P	V	N	E	A	M	S	T	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	P	G	L	.	.	S	Y	R	Q	L	A	R	E	L	T	D	Y	I	V	D	Q	G	F	T	H	V	E	L	L	P	V	A	E	H	P	F	A	G	S	W	G	Y	Q	V	T	S	Y	Y	A	P	T	S	R	F	G
Template Known Secondary structure						T	T			G	G	G	S									T	T	T	S	S	T	T		.	.																	T		S					S						S		G	G	G	T	T		S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.			270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T
Query Conservation															.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	D	D	F	R	A	L	V	D	A	L	H	Q	A	G	I	G	V	I	V	D	W	V	P	A	H	F	P	K	D	A	W	A	L	G	R	F	D	.	.	.	.	.	G	T	P	L	Y	E	H	S	D	P	K	R	G	E	Q	L	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T									T	T						T	T	T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	S	S			S	B						S	S	S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.						.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.												.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L
Query Conservation																																			.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	V	F	D	F	G	R	P	E	V	R	N	F	L	V	A	N	A	L	Y	W	L	Q	E	F	H	I	D	G	L	R	V	D	A	V	A	S	M	L	Y	L	D	Y	S	R	P	E	G	G	W	T	P	N	V	H	G	G	R	E	N	L	E	A	V	Q	F	L	Q	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.					B		T	T	S																		S										T					B							S	S			S				S	S		S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.
Query SS confidence																																																																			.
Query Sequence		L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	.	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F
Query Conservation																																																																			.
Alig confidence																																																																			.
Template Conservation
Template Sequence		M	N	A	T	A	H	K	V	A	P	G	I	V	T	I	A	E	E	S	T	P	W	S	G	V	T	R	P	T	N	I	G	G	L	G	F	S	M	K	W	N	M	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	V	S	R	D	P	V	Y	R	S	Y	H	H	H	E	M	T	F	S	M	L	Y	A	F	S	E	N	Y	V	L
Template Known Secondary structure										S	T	T									S	S				T	T	S		G	G	G	T					S																	S		G	G	G	G	G	G	G						G	G	G	G	T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	S	H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	V	H	G	K	G	T	L	W	G	R	M	P	G	N	N	H	V	K	A	A	G	L	R	S	L	L	A	Y	Q	W
Template Known Secondary structure					G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	S	T	T	S							S		S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		528	.	530	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																														.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	P	G	K	Q	L	L	F	M	G	Q	E	F	G	Q	R	A	E	W	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	G	L	D	W	F	Q	L	D	.	.	.	.	.	E	N	G	F	S	N	G	I	Q	R	L	V	R	D	I	N	D	I	Y	R	C	H	P	A	L	W	S	L	D	T	T	P
Template Known Secondary structure			S	S	S						T	T	G	G	G	T			S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	S	S	S	S																			G	G	G	T	T	T	T	T	S	G
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.												.	.	.	590	.	.	.	.	.	.						.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
						491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.				.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	.	.	.	V	N	I	T	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	Y	S	W	I	D	A	N	D	S	A	N	N	V	L	S	F	M	R	Y	G	S	D	G	S	V	L	A	C	V	F	N	F	A	G	A	E	H	R	D	Y	R	L	G	L	P	R	A	G	R	W	R	E	V	L	N	T	D	A	T	I	Y	H	G	S	G	I	G	N	L	G	G	V	D	A	T	D	D	P
Template Known Secondary structure		G	G									T	T	T	T									T	T	S										S	S	S										S	S										T	T		G	G	G	T	S				S		T	T						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.
										547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	H	G	R	P	A	S	A	V	L	V	L	P	P	T	S	A	L	W	L	T
Template Known Secondary structure		B	T	T	B	S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		709	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.