Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 103 Aligned Residues 438 % Identity 16% Template c3hjeA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:704aa long hypothetical glycosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of sulfolobus tokodaii hypothetical2 maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

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		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																															.	.																																.	.	.	.	.										.	.
Query SS confidence																															.	.																																.	.	.	.	.										.	.
Query Sequence		P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	.	.	M	S
Query Conservation																															.	.																																.	.	.	.	.										.	.
Alig confidence																															.	.																																.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	F	S	E	I	R	N	R	L	D	Y	F	V	E	L	G	V	T	H	L	Y	L	S	P	V	L	K	A	R	P	G	S	T	H	G	Y	D	V	V	D	Y	N	T	I	N	D	E	L	G	G	E	E	E	Y	I	R	L	I	D	E	A	K	S	K	G	L	G	I	I	Q	D	I	V	P	N	H	M	A	V	H
Template Known Secondary structure								T	T								T		S											S	T	T		S	S	S		S									G	G	G	T																T										S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	.	.	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R
Query Conservation													.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	T	N	W	R	L	M	D	V	L	K	K	G	R	H	S	R	Y	Y	N	Y	F	D	F	Y	E	E	E	E	K	I	R	I	P	I	L	G	D	R	N	F	K	I	T	Y	V	N	D	E	P	Y	L	D	Y	Y	G	N	L	F	P	I	N	D	E	G	R	N	Y	L	N	D	I	E	K	L	L	K	V	Q	Y
Template Known Secondary structure		T	T											G	G	G	S	G	G	G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S									T	T							T	T							T	T	G	G	G		T	T								T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.												.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	L	W	T	T	F	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	L	V	D	W	R	D	Y	P	S	Y	R	R	F	F	A	V	N	E	L	I	A	V	R	Q	E	L	E	W	V	F	E	D	S	H	S	.	.	.	K	I	L	S	F	E	V	D	G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	E	Y	L	R	R	L	K
Template Known Secondary structure							T	T	S			S	B				T	T							B		T	T	S									T	.	.	.	T	G	G	G	S			S					T	T	G	G	G		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.				210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.												230	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.																		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		N	K	I	.	.	.	.	G	N	K	H	I	F	V	E	K	I	L	S	I	G	E	K	L	.	.	.	.	.	R	W	D	F	I	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L	L	F	T	D	N	E	D	K	M	T	E	I	Y	K	N	I	L	D	I	D	L	D	E	L	V	K	E	T	K	K	K	I
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	T	T											T	T				.	.	.	.	.	S		T	T	S				S	S									T	T	S													T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.					.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.						.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																																												319	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	L	T	L	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	T	L	F	K	H	D	I	E	R	I	S	M	M	L	G	V	N	Y	E	E	I	K	E	F	L	S	C	L	K	V	Y	R	T	Y	I	T	E	N	D	F	R	D	E	E	I	I	R	N	C	S	Q	K	V	Y	E	S	M	K	K	N	V	T	A	F	M	K	L	Q	Q	Y	M	P	A	V	F	A	K	A
Template Known Secondary structure						S												T	S														S	S					B	T	T	B		T	T																											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330			.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure								.	.																																																																								.
Query SS confidence								.	.																																																																								.
Query Sequence		S	S	N	T	T	W	.	.	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	.
Query Conservation								.	.																																																																								.
Alig confidence								.	.																																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Conservation																																													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	D	T	V	L	F	I	Y	N	R	L	I	S	L	N	E	V	G	S	D	L	H	Y	Y	S	I	S	C	D	K	F	H	E	F	N	L	K	R	V	G	T	L	.	S	F	N	A	T	S	T	H	D	T	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	D	V	R	M	R
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	G	G	G	T			S		G	G	G		S	T	T			T	T		S													T	T	T	T			.					S			T	T		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.		.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	A	I	S	E	I	P	D	E	W	A	K	K	V	N	E	W	H	N	I	L	N	P	N	I	D	K	N	D	E	Y	R	L	Y	Q	T	I	V	G	S	F	D	G	F	N	N	E	Y	K	E	R	L	K	A	H	M	I	K	A	L	R	E	A	K	V	H	T	D	W	V	N	V	N	T	E	Y	E	K	K
Template Known Secondary structure						T	T	S																			S																			S	S																			T	S	S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
																															402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	Y	L	I	D	K	M	F	N	N	E	K	F	M	E	S	F	L	E	F	E	S	K	I	D	K	M	G	K	V	K	S	L	S	L	V	A	L	K	I	T	S	P	G	V	A	D	F	Y	Q	G	L	E	N	F	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	T	D	P	D	N	R	R	P	V	V	F
Template Known Secondary structure										T	T																																	S	S	S						T	T	T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.										590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.		.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.		.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure													.																						.
Query SS confidence													.																						.
Query Sequence		K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	.	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	.	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T
Query Conservation													.																						.
Alig confidence													.																						.															.								.	.	.	.
Template Conservation																																																		.								.	.	.	.
Template Sequence		S	E	L	P	K	R	Y	E	E	G	L	F	N	N	G	R	I	K	A	Y	V	T	K	V	L	L	N	L	R	K	S	M	K	D	F	F	I	N	S	E	Y	K	P	L	K	L	Q	K	.	G	L	C	G	F	M	R	.	.	.	.	G	D	K	V	L	V	I	V	K	T	L	N	R	D	Y	D	I	E	I	D
Template Known Secondary structure							S			G	G	G	T	T	T	S	T																T	T	T					S									T	.	T							.	.	.	.	T	T	T							S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.								.	.	.	.
Template SS confidence
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.					.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.																		.
Template Conservation		.																		.
Template Sequence		.	G	E	Y	T	D	V	I	T	D	E	T	V	R	G	R	V	K	.	V	D	K	L	P	L	I	L	V	K
Template Known Secondary structure		.						T	T	T	T									.			S	S
Template Predicted Secondary structure		.																		.
Template SS confidence
			678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.		.	.	.	.	.	700	.	.	.	.