Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 433 % Identity 18% Template c3faxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:reticulocyte binding protein; PDBTitle: the crystal structure of gbs pullulanase sap in complex with2 maltotetraose Resolution 2.40 Å

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.								.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	I	A	N	F	K	G	R	Q	D	A	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	T	S	D	Q	S	L	D	G	K	N	Q	L	G	T	F	A	A	F	S	E	K	L	D	Y	L	Q	K	L	G	V	T	H	I	Q	L	L	P	V	L	S	Y	F	Y	V	N	E	M	D	K	S	R	S	T	A	Y	T	S	S
Template Known Secondary structure					T	T			S	G	G	G															G	G	G						T	T	S							T								T		S					S			B		B	S	S		B	T	T							S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		602	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.
						95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.									.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A
Query Conservation		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	N	Y	N	W	G	Y	D	P	Q	S	Y	F	A	L	S	G	M	Y	S	E	K	P	K	D	P	S	A	R	I	A	E	L	K	Q	L	I	H	D	I	H	K	R	G	M	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	T	A	K	T	Y	L	F	E	D	I	.	.	.	.	.	.	.	E	P	N	Y	Y	H	F
Template Known Secondary structure		S		S				S		S	B	S		S	S	S	B		G	G	G		S		T	T	S																		T	T										S			S		T					T	T	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.								750	.	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K
Query Conservation																																																																.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.																.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.
Template Sequence		M	N	E	D	G	S	P	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	G	G	G	R	L	G	T	T	H	A	M	S	R	R	V	L	V	D	S	I	K	Y	L	T	S	E	F	K	V	D	G	F	R	F	D	M	M	G	D	H	.	.
Template Known Secondary structure		B		T	T	S		B		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	B		B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.
Template SS confidence
		757	.	.	760	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.								290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	.	.	.	.	.	.	.	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	A	A	I	E	L	A	Y	K	E	A	K	A	I	N	P	N	M	I	M	I	G	E	G	W	R	T	F	Q	G	D	Q	G	K	P	V	K	P	A	D	Q	D	W	M	K	S	T	D	T	V	G	V	F	S	D	D	I	R	N	S	L	K	S	G	F	P	N	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B																T	T									S					B	T	T	B				B	S	S	G	G	G	G	G	G		S	S																T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													808	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.
													310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.				.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	.	.	.	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	P	A	F	I	T	G	G	P	Q	S	L	Q	G	I	F	K	N	I	K	A	Q	P	G	N	F	E	A	D	S	P	G	D	V	V	Q	Y	I	A	A	H	D	N	L	T	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T				T	T	T	T													T	T			T	T	S			S	S	G	G	G					S			S	S	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		877	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	I	A	K	S	I	N	K	D	P	K	V	A	E	E	D	I	H	R	R	L	R	L	G	N	V	M	I	L	T	S	Q	G	T	A	F	I	H	S	G	Q	E	Y	G	R	T	K	R	L	L	N	P	D	Y	M	T	K	V	S	D	K	L	P	N	K	A	T	L	I	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.								T			T	T	T	T																	T	S	S	S						T	T	T	T	T	T				B				G	G	G	S	S								T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										925	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.
											439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.
Template Sequence		V	K	E	Y	P	Y	F	I	H	D	S	Y	D	S	S	D	A	I	N	H	F	D	W	A	A	A	T	.	.	D	N	N	K	H	P	I	S	T	K	T	Q	A	Y	T	A	G	L	I	T	L	R	R	S	T	D	A	F	R	K	L	S	K	A	E	I	D	R	E	V	S	L	I	T	E	V	G	Q	G	D	I
Template Known Secondary structure				S	S					S		G	G	G															.	.		T	T	T																				T		T	T	S	S														S	S		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.
Template SS confidence
		998	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		K	E	K	D	L	V	I	A	Y	Q	T	I	D	.	S	G	D	I	Y	A	V	F	V	N	A	D	S	K	A	R	N	V	L	L	G	E	K	Y	K	H	L	L	K	G	Q	V	I	V	D	A	D	Q	A	G	I	K	P	I	S	T	P	R	G	V	H	F	E	K	D	S	L	L	I	D	P	L	T	A	I	V
Template Known Secondary structure			S			S									.												S	S	S											G	G	G	G	G	S						S	S		B	S	S	S			S	S		S	S					S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		1076	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.
		558	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1156	.