Job Description P76041 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 107 Aligned Residues 245 % Identity 19% Template c3aicC_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:glucosyltransferase-si; PDBTitle: crystal structure of glucansucrase from streptococcus mutans Resolution 3.11 Å

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		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.											220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	D	N	S	N	P	V	V	Q	A	E	Q	L	N	W	L	H	F	L	M	N	F	G	N	I	Y	A	N	D	P	D	A	N	F	D	S	I	R	V	D	A	V	D	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	D	L	L	Q	I	A	G	D	Y	L	K	A	A	K	G	I	H	K	N
Template Known Secondary structure					T	T	S															T	T							S		G	G	G								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T																T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.														.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
						264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.								.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																															.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																															.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	.	.	.	.	.	.	.	T	L	P	S	S	N	T	T	W
Query Conservation		.	.	.	.																																															.	.													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.										.																				.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.										.
Template Sequence		D	K	A	A	N	D	H	L	S	I	L	E	A	W	S	Y	N	D	T	.	.	P	Y	L	H	D	D	G	D	N	.	M	I	N	M	D	N	R	L	R	L	S	L	L	Y	S	L	A	K	P	L	N	Q	R	S	G	M	N	P	L	I	T	N	S	L	V	N	R	T	D	D	N	A	E	T	A	A	V	P	S
Template Known Secondary structure							T	T								S	T	T			.	.						T	T		S	.	S	B		B												T	T	S		G	G	G				S	T					S	S	S	S			S					S	B		S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.										.
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.			.	.	.	.	.	.	.	530	.		.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
		331	.	.	.	.	.	.	.	.																			340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	F	L	A	S	H	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	F	I	R	A	H	D	S	E	V	Q	D	L	I	R	D	I	I	K	A	E	I	N	P	N	V	V	G	Y	S	F	T	M	E	E	I	K	K	A	F	E	I	Y	N	K	D	L	L	A	T	E	K	K	Y	T	H	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S			S	S	T	T	T												T		T	T			T	T																					S	S		S	S	S		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.		.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	.	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H
Query Conservation																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	L	S	Y	A	L	L	L	T	N	K	S	S	V	P	R	V	Y	Y	G	D	M	F	T	D	D	G	Q	Y	M	A	H	K	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T		S	S	S										B		S	S	B	S	T	T		S	B		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.																														.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510															.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		A	I	E	T	L	L	K	A	R	I	K	Y	V	S	.	G	G	Q	A	M	R	N	Q	Q	V	G	N	S	E	I	I	T	S	V	R	Y	G	K	G	A	L	K	A	T	D	T	G	D	R	I	T	R	T	S	G	V	V	V	I	E	G	N	N	P	S
Template Known Secondary structure																.	S										T	T											T	T			S	T	T									T											T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		679	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.		.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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