Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 475 % Identity 19% Template c3a47A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:oligo-1,6-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of isomaltase from saccharomyces cerevisiae Resolution 1.59 Å

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		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.																																		.
Query SS confidence																											.	.	.																																		.
Query Sequence		I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	.	.	.	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G
Query Conservation																											.	.	.																																		.
Alig confidence																											.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		A	H	P	E	T	E	P	K	W	W	K	E	A	T	F	Y	Q	I	Y	P	A	S	F	K	D	S	N	D	D	G	W	G	D	M	K	G	I	A	S	K	L	E	Y	I	K	E	L	G	A	D	A	I	W	I	S	P	F	Y	D	S	P	Q	D	D	M	G	Y	D	I	A	N	Y	E	K	V	W	P	T	Y	G
Template Known Secondary structure		T		G	G	G	S														G	G	G	S			S	S	S	S	S	S									T								T		S													T	T	T	T	S	S		S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.						.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.																								.																			.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.																								.																			.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	.	.	.	.	.	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q
Query Conservation															.	.	.	.	.																								.																			.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.																								.																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	E	D	C	F	A	L	I	E	K	T	H	K	L	G	M	K	F	I	T	D	L	V	I	N	H	C	S	S	E	H	E	W	F	K	E	S	R	S	S	K	T	N	P	K	R	D	W	F	F	W	R	P	P	K	G	Y	D	A	E	G	K	P	I	P	P	N	N	W	K	S	Y	F	G	G	S	A	W	T
Template Known Secondary structure																T	T										S	B			T	T	S							T	T		S	S	S	T	T	G	G	G	B						S				T	T	S					S	S		B	B		T	T	S	S	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																																									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	E	K	T	Q	E	F	Y	L	R	L	F	C	S	T	Q	P	D	L	N	W	E	N	E	D	C	R	K	A	I	Y	E	S	A	V	G	Y	W	L	D	H	G	V	D	G	F	R	I	D	V	G	S	L	Y	S	K	V	V	G	L	P	D	A	P	V	V	D	K	N	S	T	W	Q	S	S	D	P	Y	T
Template Known Secondary structure				T	T	T	T						S	S	S	T	T			B	B		T	T													T						T	T							T	T	G	G	G	S				T	T									T	T		S	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.				.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.		.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310							.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	.	.	.	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	.	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	.	.	.	.	.	.	V	E
Query Conservation																						.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	G	P	R	I	H	E	F	H	Q	E	M	N	Q	F	I	R	N	R	V	K	D	G	R	E	I	M	T	V	G	E	M	Q	H	A	S	D	E	T	K	R	L	Y	T	S	A	S	R	H	E	L	S	E	L	F	N	F	S	H	T	D	V	G	T	S	P	L	F	R	Y	N	L	V	P	F	E	L	K	D
Template Known Secondary structure		S	S		T	T																	S	S																								G	G	G		S		S										T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330		.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	.	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	I	A	L	A	E	L	F	R	Y	I	N	G	T	D	C	W	S	T	I	Y	L	E	N	H	D	Q	P	R	S	I	T	R	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	T	G	G	G	T	T	S	S							S			T	T	S								S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	S	P	K	N	R	V	I	S	G	K	L	L	S	V	L	L	S	A	L	T	G	T	L	Y	V	Y	Q	G	Q	E	L	G	Q	I	N	F	K	N	W	P	V	E	K	Y	E	D	V	E	I	R	N	N	Y	N	A	I	K	E	E	H	G	E	N	S	E	E	M	K	K	F	L	E	A	I	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		S	T	T	T														T		S	S						T	T	G	G	G	T						S			G	G	G																			S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
					443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490			.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query SS confidence		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query Sequence		.	.	.	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	.	.	N	F	T	I
Query Conservation		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Alig confidence		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	S	R	D	H	A	R	T	P	M	Q	W	S	R	E	E	P	N	A	G	F	S	G	P	S	A	K	P	W	F	Y	L	N	D	S	F	R	E	G	I	N	V	E	D	E	I	K	D	P	N	S	V	L	N	F	W	K	E	A	L	K	F	R	K	A	H	K	D	I	T	V	Y	G	Y	D	F	E	F	I
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	T	S								T	T	T	T	T	S	S		T	T				S	S				G	G	G	G	G	T		S								T	T	S															T					T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.						.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	N	L	H	G	R	D	L	I	.	.	.	.	.	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I
Query Conservation																																														.	.	.	.	.
Alig confidence																.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		D	L	D	N	K	K	L	F	S	F	T	K	K	Y	.	N	N	K	T	L	F	A	A	L	N	F	S	S	D	A	T	D	F	K	I	P	N	D	D	S	S	F	K	L	E	F	G	N	Y	P	K	K	E	V	D	A	S	S	R	T	L	K	P	W	E	G	R	I	Y
Template Known Secondary structure		S	T	T		S	S									.	T	T										S	S	S							T	T			T	T							S	S		G	G	G			T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.		.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.