Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 428 % Identity 21% Template c2z1kA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:(neo)pullulanase; PDBTitle: crystal structure of ttha1563 from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.30 Å

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.																						.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	.	.	.	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	D	D	G	F	S
Query Conservation																			.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	Y	E	G	A	F	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	F	R	A	G	P	P	G	R	P	A	P	A	G	P	F	E	P	W	E	A	P	P	T	L	R	G	F	K	G	G	T	L	W	G	V	A	E	K	L	P	Y	L	L	D	L	G	V	E	A	I	Y	L	N	P	V	F	A	S	T	A	N	H	R	Y	H
Template Known Secondary structure		T	T	S	S								G	G	G	S				S				S	S				S					T	T	S				S	S													T								T													S	S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	.	.	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A
Query Conservation																											.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																							.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	D	Y	F	Q	V	D	P	I	L	G	G	N	E	A	L	R	H	L	L	E	V	A	H	A	H	G	V	R	V	I	L	D	G	V	F	N	H	T	G	R	G	F	F	A	F	Q	H	L	X	E	N	G	E	Q	S	P	Y	R	D	W	Y	H	V	K	G	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										G	G	G	T															T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	L	K	A	Y	T	A	H	P	N	Y	E	A	W	W	G	N	P	E	L	P	K	L	K	V	E	T	P	A	V	R	E	Y	L	L	A	V	A	E	H	W	I	R	F	G	V	D	G	W	R	L	D	V	P	N	E	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	T	F	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.			T	T	S	S	S		S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		T							S	S	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.													.	210	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	E	F	R	Q	R	V	K	G	A	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	I	W	E	E	A	D	F	W	L	Q	.	.	.	.	.	G	D	X	F	D	A	V	X	N	Y	P	L	A	R	A	V	L	G	F	V	G	G	E	A	L	D	R	D	L	A	A	Q	T	G	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T								S	S			S	G	G	G	S	.	.	.	.	.	S	S	S		S			B														G	G	G	S						T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.						.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	R	I	E	P	L	Q	A	L	A	F	S	H	R	L	E	D	L	F	G	R	Y	R	P	E	V	V	R	A	Q	X	N	L	L	T	S	H	D	T	P	R	L	L	S	L	X	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	V	E	R	A	R	L	A	L	A	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S																	T	T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.																.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	L	L	P	G	N	P	T	V	Y	Y	G	E	E	V	G	X	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	K	D	P	E	N	R	G	G	X	V	W	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	W	Q	K	D	L	R	E	T	V	K	R	L	A	R	L	R	K	E	H	P	A	L	R	T	A	P	Y	L
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	T	T								G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S																			T					S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.										.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370									.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530								.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.						.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	E	.	.	.	.	.	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Alig confidence								.								.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation								.								.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	Y	A	Q	D	.	G	H	L	A	F	A	R	.	.	.	.	.	G	P	Y	L	A	V	V	N	A	S	P	H	P	F	R	Q	D	F	P	L	H	G	V	F	P	R	G	G	R	A	V	D	L	L	S	G	E	V	C	T	P	Q	G	G	R	L	C	G	P	V	L	P	P	F	S	L	A	L	W	R
Template Known Secondary structure							T	.	T							.	.	.	.	.	T	T								S	S	S						S	B		T	T	S		T	T							T	T	T							B	T	T	B								T	T
Template Predicted Secondary structure								.								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.						.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.