Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 438 % Identity 17% Template c2wcsA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha amylase, catalytic region; PDBTitle: crystal structure of debranching enzyme from nostoc2 punctiforme (npde) Resolution 2.80 Å

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		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	Q	T	P	D	W	V	K	H	A	V	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	K	Q	P	R	K	R	L	L	Q	E	A	R	W	E	D	W	D	S	M	P	T	L	Q	G	Y	K	G	G	D	L	W	G	I	M	E	D	L	D	Y	I	Q	N	L	G	I	N	A	I	Y	F	T	P	I	F	Q	S
Template Known Secondary structure							T	T	G	G	G								G	G	G	T				S	S					S		T	T			T	T	T	G	G	G						T			S									T								T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.			.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		S	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S
Query Conservation																																		.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	N	H	R	Y	H	T	H	D	Y	Y	Q	V	D	P	M	L	G	G	N	E	A	F	K	E	L	L	D	A	A	H	Q	R	N	I	K	V	V	L	D	G	V	F	N	H	S	S	R	G	F	F	F	F	H	D	V	L	E	N	G	P	H	S	P	W	V	N	W	F	K	I	E	G	W	P	L	S	P	Y
Template Known Secondary structure		S	T	T		T	T	S									G	G	G	T															T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	F	P	A	N	Y	V	G	W	A	G	N	R	A	L	P	E	F	N	H	D	N	P	E	V	R	E	Y	I	M	E	I	A	E	Y	W	L	K	F	G	I	D	G	W	R	L	D	V	P	F	E	I	K	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S			S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		T								S	T	T	S				T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162																.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	F	W	Q	E	F	R	D	R	T	K	A	I	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	V	W	G	D	S	R	Q	W	L	D	.	.	.	.	.	G	T	Q	F	D	G	V	M	N	Y	L	F	A	G	P	T	I	A	F	A	A	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T														T	T									S			G	G	G		S	.	.	.	.	.	S	S	S		S																T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250						.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	V	L	E	Q	V	Q	S	R	D	Y	Q	P	Y	P	P	L	F	A	A	E	Y	A	T	K	I	Q	E	V	L	Q	L	Y	P	W	E	I	Q	L	T	Q	L	N	L	L	A	S	H	D	T	A	R	L	M	T	I	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	A	S	V
Template Known Secondary structure		G			S	S	S			T	T	T					S																T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.																.	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	S	T	L	L	L	L	T	F	P	G	A	P	S	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	D	P	D	S	R	R	G	F	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	W	N	Q	E	I	F	N	T	H	R	Q	L	I	T	I	R	Q	T	Y	P	A
Template Known Secondary structure									T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.										.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.											.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530													.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.		.	.	.	550	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	.	E	I	T	L	R	P
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Alig confidence														.											.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation														.											.
Template Sequence		L	R	T	G	D	Y	Q	V	L	Y	A	Q	.	G	Q	L	Y	L	F	A	R	T	L	.	G	T	E	E	L	I	I	A	I	N	A	G	T	S	S	A	T	A	N	V	D	V	A	S	L	H	T	Q	P	N	K	L	L	Y	G	T	A	E	A	E	W	N	G	E	E	G	T	Q	Q	L	S	L	T	L	P	A
Template Known Secondary structure					S									.	T	T									.	T	T										S	S	S										S		S	S								S										S	T	T									S
Template Predicted Secondary structure														.											.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		553	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	S	G	C	I	L	G
Template Known Secondary structure		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.