Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 412 % Identity 15% Template c2taaA_ PDB info PDB header:hydrolase (o-glycosyl) Chain: A: PDB Molecule:taka-amylase a; PDBTitle: structure and possible catalytic residues of taka-amylase a Resolution 3.00 Å

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		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.																.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.									.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	D
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.
Template Sequence		T	P	A	D	W	.	R	S	Q	S	I	Y	F	L	L	T	D	R	F	A	R	T	D	G	S	T	T	A	T	C	N	T	A	D	Q	K	Y	C	G	G	T	W	Q	G	I	I	D	K	L	D	Y	I	Q	G	M	G	F	T	A	I	W	I	T	P	V	T	A	Q	L	P	Q	D	C	A	Y	G	D	A	Y	T
Template Known Secondary structure			T	T	T	G	.	G	G	S							B	T	T	B			T	T			T	T					G	G	G		S						G	G	G	G	G	T																			S				S	S			T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.		.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	.	.	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R
Query Conservation																														.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.																							.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	W	Q	T	D	I	Y	S	L	N	E	N	Y	G	T	A	D	D	L	K	A	L	S	S	A	L	H	E	R	G	M	Y	L	M	V	D	V	V	A	N	H	M	G	Y	D	G	A	G	S	S	V	D	Y	S	V	F	K	P	F	S	S	Q	D	Y	F	H	P	F	C	F	I	Q	N	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S	S	S	S			S	S	S			T	T													S									T	T	B					S		G	G	G				S	S		T	T		S	S	S	T	T	B					B			S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.
Query SS confidence																																																				.
Query Sequence		P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T
Query Conservation																																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	D	Q	T	Q	V	E	D	C	W	L	G	D	N	T	V	S	L	P	D	L	D	T	T	K	D	V	V	K	N	E	W	Y	D	W	V	G	S	L	V	S	N	Y	S	I	D	G	L	R	I	D	T	V	K	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G		S	S	T	T	T	S	B				T	T					B	B			S	S	S															T	T	T			S					T	T		S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.														.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.				310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																						.	.	.																							.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Sequence		K	D	F	W	P	G	Y	N	K	A	.	.	.	.	.	A	G	V	Y	C	I	G	E	V	L	D	G	D	P	A	Y	T	C	P	Y	Q	.	.	.	N	V	M	D	G	V	L	N	Y	P	I	Y	Y	P	L	L	N	A	F	K	S	T	S	G	S	M	D	D	L	Y	N	M	I	N	T	V	K	S	D	C	P
Template Known Secondary structure		T	T									.	.	.	.	.	S		S															T	G	G	G	.	.	.	T	T	T	S	B														S	S	S	T	T			T														B
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.						.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.				.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	S	T	L	L	G	T	F	V	E	N	H	D	N	P	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	Y	T	N	D	I	A	L	A
Template Known Secondary structure			T	T						S	S		T	T	S			G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	V	A	A	F	I	I	L	N	D	G	L	P	I	I	Y	A	G	Q	E	Q	H	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	D	P	A	N	R	E	A	T	W	L	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	T	D	S	E	L	Y	K	L	I	A	S	A	N	A	I	R	N	Y	A	I	S
Template Known Secondary structure											S	S	S						T	T	T	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	T	T				G	G	G	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.										.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.									.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		486	.	.	.			490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530									.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.						.	.	.	550
Predicted Secondary structure						.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	H	P	D	.	.	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	.	.	.	.	.	E	I	T	L
Query Conservation						.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	D	T	G	F	V	T	Y	K	N	P	Y	I	K	D	D	T	T	I	A	M	R	K	G	T	D	G	S	Q	I	V	T	I	L	S	N	K	G	A	S	G	D	S	Y	T	L	S	L	S	G	A	S	Y	T	A	G	Q	Q	L	T	E	V	I	G	C	T	T	V	T	V	G	S	D	G	N	V	P	V	P	M
Template Known Secondary structure			S			T	T	T	S								S	S	S								S	T	T											T	T									S	S					T	T						S	T	T								T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	P	W	Q	V	M	W	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	G	G	L	P	R	V	L
Template Known Secondary structure		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.