Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 459 % Identity 17% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.							.	.	.	.	.	.	70	.	.												.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	Y	G	G	T	F	T	A	T	H	L	Q	K	L	V	T	R	L	E	S	A	K	R	L	I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.																			.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		D	Q	Y	A	K	A	V	T	V	N	G	E	K	G	V	V	L	R	P	D	Q	M	K	W	T	A	P	L	K	P	F	S	H	P	.	V	D	A	V	I	Y	E	T	H	L	R	D	F	S	I	H	E	N	S	G	M	I	N	K	G	K	Y	L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	A	N	G	S	S	S	G	L
Template Known Secondary structure			T	T		S	S	B		G	G	G		S																			S		G	.	G	G														S	T	T	S			S	S	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T		B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.		.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.											.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.									.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	W	G	Y	N	P	L	H	F	F	A	P	E	G	S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q	T	R	K	T	E	L	K	Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V
Template Known Secondary structure								T		S					S						S	S	S		T	T	S	G	G	G							S									S	T	T	S	S		S	S	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		C	N	H	M	S	A	K	S	E	.	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L
Query Conservation											.
Alig confidence											.						.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	P	F	E	K	T	.	.	.	.	.	.	V	P	G	Y	F	F	R	H	D	E	C	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	N	G	T	G	V	G	N	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K
Template Known Secondary structure		T	T			S	S	G	G	G	S						.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	S	B		B		T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B			T	T	S	S	S			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.							.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D
Query Conservation												.
Alig confidence												.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	I	A	D	C	V	V	Y	W	L	E	E	Y	N	V	D	G	F	R	F	D	L	L	G	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	A	K	P	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A
Template Known Secondary structure																						T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B															S	T	T													S	S		G	G	G	B			G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.														.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
		289	290	.						.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.									.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	H	.	.	.	.	.	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	Q	K	Q	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L
Query Conservation					.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	P	R	M	P	G	I	G	F	F	N	D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F	A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	K	A	L	A	P	I	V	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G		T	T																S	S	S	T	T				G	G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	T	T	B			S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	.	.	.	.	.	.	S	F	A	L	P	Q	E	N	D	S	R	K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L	L	A	Q	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	.	.	.	K	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G					S			S	S	S	S							.	.	.	.	.	.					T	T																			T	S	B	S						T	T	G	G	G	T			.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Template SS confidence
										514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.							.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.				.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.							.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	.	.	.	.	.	.	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S	I	N	Q	L	D	W	D	R	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S	L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A	A	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L	K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L
Template Known Secondary structure		T		S			T	T							S								.	.	.	.	.	.	.	.		T																		G	G	G	G			S															S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.									.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
		510	.					.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.								.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	.	.	.	.	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	N	L	H	G	R	D	L	I	.	.	.	.	.	.	.	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S	V	E	W	R	L	P	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	S	G	F	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	T	V	A	V	N	G	I	G	T	V	I	L	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T		S	S	S									S	S	S							S	S		S								T	T											S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.