Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 471 % Identity 20% Template c1zjaB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:trehalulose synthase; PDBTitle: crystal structure of the trehalulose synthase mutb from2 pseudomonas mesoacidophila mx-45 (triclinic form) Resolution 1.60 Å

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.																																		.
Query SS confidence																								.	.	.																																		.
Query Sequence		R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	.	.	.	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q
Query Conservation																								.	.	.																																		.
Alig confidence																								.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		K	P	G	A	P	W	W	K	S	A	V	F	Y	Q	V	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	G	D	G	I	G	D	F	K	G	L	T	E	K	L	D	Y	L	K	G	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	A	S	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	R	E	V	M	K	E	Y	G	T	M	E
Template Known Secondary structure																		G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T															T	T	T	T	S	S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence												.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H
Query Conservation												.	.	.	.	.																								.
Alig confidence												.	.	.	.	.																								.													.
Template Conservation																																																					.
Template Sequence		D	F	D	R	L	M	A	E	L	K	K	R	G	M	R	L	M	V	D	V	V	I	N	H	S	S	D	Q	H	E	W	F	K	S	S	R	A	S	K	D	N	P	Y	R	D	Y	Y	F	W	R	D	.	G	K	D	G	H	E	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	E	K	D	P	V	T	G	Q	Y
Template Known Secondary structure													T	T										S	B			T	T	S								T		S	S	S	T	T	G	G	G	B					.		B	T	T	B		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.														.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	H	Y	F	G	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	T	P	K	L	R	E	E	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	T	P	G	F	P	D	L	T	P	E	Q	M	K	N	F	A	E	A	Y	T	Q	G	P	N	L	H	R	Y	L	Q	E	M
Template Known Secondary structure					S	S		T	T			B	B		T	T																	T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.		.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310						.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	.	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	.	.	.	.	.	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T
Query Conservation																																		.																								.	.	.	.	.
Alig confidence								.																										.																								.	.	.	.	.
Template Conservation								.
Template Sequence		H	E	K	V	F	D	.	H	Y	D	A	V	T	A	G	E	I	F	G	A	P	L	N	Q	V	P	L	F	I	D	S	R	R	K	E	L	D	M	A	F	T	F	D	L	I	R	Y	D	R	A	L	D	R	W	H	T	I	P	R	T	L	A	D	F	R	Q	T	I	D	K	V	D	A	I	A	G	E	Y	G	W
Template Known Secondary structure					T	G	G	.	G	S										S			G	G	G							G	G	G		S		S					S	T	T	T	T	T	T	B		T	T	S	S		B																				T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.		.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	F	F	L	G	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A
Template Known Secondary structure		B				S			T	T	S								S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	T	L	T	Q	R	G	T	P	F	I	F	Q	G	D	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	K	T	L	Q	D	F	D	D	I	E	V	K	G	F	F	Q	D	Y	V	E	T	G	K	A	T	A	E	E	L	L	T	N	V	A	L	T	S	R	D	N	A	R	T	P	F	Q	W	D	D	S	A	N	A	G	F
Template Known Secondary structure					T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T								S	G	G	G														T	T	T	T	S	S														G	G	G	G	T	S					S	S	S	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S
Query Conservation
Alig confidence																																																																					.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		T	T	G	K	P	W	L	K	V	N	P	N	Y	T	E	I	N	A	A	R	E	I	G	D	P	K	S	V	Y	S	F	Y	R	N	L	I	S	I	R	H	E	T	P	A	L	S	T	G	S	Y	R	D	I	D	P	S	N	A	D	V	Y	A	Y	T	R	S	Q	.	D	G	E	T	Y	L	V	V	V	N	F	K
Template Known Secondary structure			S	S			S	S				G	G	G	G	T	S							T		T	T	S														T		T					S					S		T	T		S	S									.	T	T										S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.		.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.								.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	N	I	Q	H	V	N	I	T	N	L	H	G	R	D	L	I	.	.	.	.	.	.	.	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	P	R	S	F	T	L	P	D	G	M	H	I	A	E	T	L	I	E	S	S	S	P	A	A	P	A	A	G	A	A	S	L	E	L	Q	P	W	Q	S	G	I	Y	K
Template Known Secondary structure		S	S								T	T											S		S	S				T	T		S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.