Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 429 % Identity 17% Template c1tcmB_ PDB info PDB header:glycosyltransferase Chain: B: PDB Molecule:cyclodextrin glycosyltransferase; PDBTitle: cyclodextrin glycosyltransferase w616a mutant from bacillus2 circulans strain 251 Resolution 2.20 Å

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		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																	.	.
Query Sequence		I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	.	.	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	T	S	V	S	N	K	Q	N	F	S	T	D	V	I	Y	Q	I	F	T	D	R	F	S	D	G	N	P	A	N	N	P	T	G	A	A	F	D	G	T	C	T	N	L	R	L	Y	C	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	S	Q	P	V	E	N
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T		T	T			T	T								T	T	T	T			S		T	T	S				G	G	G	B		S	S			S	T	T	S	B														S	S	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
												91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	W	S	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	H	P	G	F	E	D	F	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	S	I	I	N	Y	S	G	V	N	N	T	A	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	K	T	N	P	A	Y	G	T	I	A	D	F	Q	N	L	I	A	A	A	H	A	K	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	S	D	Q	P	S	F	A	E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T
Template Known Secondary structure									T	T						T	T			S									T	T	T																T	T										S				B			S	S		T	T	S	T	T	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.																																	.																																							.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.																																	.																																							.
Template Sequence		L	L	.	.	.	.	.	.	G	G	Y	T	N	D	T	Q	N	L	F	H	H	N	G	G	T	D	F	S	T	T	E	N	G	I	Y	K	N	L	Y	D	.	L	A	D	L	N	H	N	N	S	T	V	D	V	Y	L	K	D	A	I	K	M	W	L	D	L	G	I	D	G	I	R	M	D	A	V	K	H	M	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.			S	T	T			S			B			S		B				S	S						S	S	B	B	T	T	.	B			B		T	T	S																	T	T							T	T	T	T	S	S	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.																																	.																																							.
Template SS confidence
		163	.							.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.		.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310				.
Predicted Secondary structure																																								.																																						.	.	.
Query SS confidence																																								.																																						.	.	.
Query Sequence		K	E	P	G	T	S	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	.	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	N	.	.	.	V
Query Conservation																																								.																																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.									.																																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	G	W	Q	K	S	F	M	A	A	V	N	N	Y	K	P	.	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	V	N	E	V	S	P	E	N	H	K	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	A	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	N	M	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S		.											T	T													S	S				B													T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
														235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	K	A	M	L	E	G	S	A	A	D	Y	A	Q	V	D	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	M	E	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	T	T	G	G	G	S				S			T	T	S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	H	A	S	N	A	N	R	R	K	L	E	Q	A	L	A	F	T	L	T	S	R	G	V	P	A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	D	P	D	N	R	A	R	I	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	T	S	T	T	A	Y	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S		T	T	S													T	T	S	S	S			B			T	T	G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.										.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380											.	.	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530																.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.
Template Sequence		V	I	Q	K	L	A	P	L	R	K	C	N	P	A	I	A	Y	G	S	T	Q	E	R	W	I	N	.	N	D	V	L	I	Y	E	R	K	F	G	S	N	V	A	V	V	A	V	N	R	N	L	N	A	P	A	S	I	S	G	L	V	T	S	L	P	Q	G	S	Y	N	D	V	L	G	G	L	L	N	G	N	T
Template Known Secondary structure							T	T										S										.	S	S									T	T											T	T							S		B		S			S						T	T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	S	V	G	S	G	G	A	A	S	N	F	T	L	A	A	G	G	T	A	V	W
Template Known Secondary structure						T	T	S	B	B							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490