Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 468 % Identity 20% Template c1m53A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:isomaltulose synthase; PDBTitle: crystal structure of isomaltulose synthase (pali) from2 klebsiella sp. lx3 Resolution 2.20 Å

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		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.																																		.
Query SS confidence																					.	.	.																																		.
Query Sequence		K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	.	.	.	N	D	L	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P	W	S	.	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q
Query Conservation																					.	.	.																																		.
Alig confidence																					.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	W	W	K	E	A	V	F	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	D	D	G	I	G	D	I	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	K	S	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	D	S	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	N	Y	R	Q	I	M	K	E	Y	G	T	M	E	D	F	D
Template Known Secondary structure															G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T															T	T	T	T	S	S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence									.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	Q	.	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L	S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T
Query Conservation									.	.	.	.	.																								.
Alig confidence									.	.	.	.	.																								.													.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		S	L	V	A	E	M	K	K	R	N	M	R	L	M	I	D	V	V	I	N	H	T	S	D	Q	H	P	W	F	I	Q	S	K	S	D	K	N	N	P	Y	R	D	Y	Y	F	W	R	D	.	G	K	D	N	Q	P	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	Q	K	D	A	K	S	G	Q	Y	Y	L	H
Template Known Secondary structure										T	T										S	B			T	T	S										T	T		T	T	G	G	G	B					.		S	S	S	S		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.														.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	I	H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	F	A	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	N	P	K	V	R	E	D	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	I	P	G	F	P	N	L	T	P	E	Q	Q	K	N	F	A	E	Q	Y	T	M	G	P	N	I	H	R	Y	I	Q	E	M	N	R	K
Template Known Secondary structure		S	S		T	T			B	B		T	T	S																T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.		.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.						310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330		.
Predicted Secondary structure																															.																							.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence																															.																							.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	.	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	.	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L	T	L	P	S	S	N	T	T	W	.	F
Query Conservation																															.																							.	.	.	.	.																						.
Alig confidence					.																										.																							.	.	.	.	.																						.
Template Conservation					.
Template Sequence		V	L	S	.	R	Y	D	V	A	T	A	G	E	I	F	G	V	P	L	D	R	S	S	Q	F	F	D	R	R	R	H	E	L	N	M	A	F	M	F	D	L	I	R	L	D	R	D	S	N	E	R	W	R	H	K	S	W	S	L	S	Q	F	R	Q	I	I	S	K	M	D	V	T	V	G	K	Y	G	W	N	T
Template Known Secondary structure		T	G	G	.	G	S									T	T			G	G	G	T						G	G	G		S		S						T	T	T	T	T	T	B		S	S		T	T		B																				T	T	T			B
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		284	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D	E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	F	L	D	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	I
Template Known Secondary structure				S			T	T	S								S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	T	Q	R	A	T	P	F	I	Y	Q	G	S	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	R	Q	L	N	E	F	D	D	I	E	V	K	G	F	W	Q	D	Y	V	Q	S	G	K	V	T	A	T	E	F	L	D	N	V	R	L	T	S	R	D	N	S	R	T	P	F	Q	W	N	D	T	L	N	A	G	F	T	R
Template Known Secondary structure			T	S	S	S	S						T	T	T	T	T	T								S	G	G	G														T	T	T	T	S	S														G	G	G	G		S					S	S	S	G	G	G	G	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T	L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N
Query Conservation
Alig confidence																																																																			.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		G	K	P	W	F	H	I	N	P	N	Y	V	E	I	N	A	E	R	E	E	T	R	E	D	S	V	L	N	Y	Y	K	K	M	I	Q	L	R	H	H	I	P	A	L	V	Y	G	A	Y	Q	D	L	N	P	Q	D	N	T	V	Y	A	Y	T	R	T	L	.	G	N	E	R	Y	L	V	V	V	N	F	K	E	Y
Template Known Secondary structure		S			S	S				G	G	G	G	T	S									T	T	S																					S					S		T	T		S	S									.	T	T										S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.							.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	H	V	N	I	T	N	L	H	G	R	D	L	I	.	.	.	.	.	.	S	E	V	D	I	L	G	N	E	I	T	L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	R	Y	T	L	P	A	N	D	A	I	E	E	V	V	I	D	T	Q	Q	Q	A	A	A	P	H	S	T	S	L	S	L	S	P	W	Q	A	G	V	Y	K
Template Known Secondary structure									T	T										S		S	S						S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.