Job Description P76041 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:40 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 420 % Identity 19% Template c1gviA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltogenic amylase; PDBTitle: thermus maltogenic amylase in complex with beta-cd Resolution 3.3 Å

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		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	I	T	Q	R	R	K	K	H	W	D	E	S	D	V	V	L	I	T	Y	A	D	Q	F	H	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	P	T	F	N	Q	F	Y	H	Q	W	L	Q	S	I	F	S	H	V	H	L	L	P	F	Y	P
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	R	V	D	L	F	Q	A	P	D	W	V	K	D	T	V	W	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	N	P	A	I	S	P	K	G	A	R	P	W	G	S	E	D	P	T	P	T	S	F	F	G	G	D	L	Q	G	I	I	D	H	L	D	Y	L	A	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R
Template Known Secondary structure			S	S	S						G	G	G	G	T								G	G	G	T				S					S	S			S				S	S				S	S													T								T										B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		W	S	S	D	D	G	F	S	V	I	D	Y	H	Q	V	A	S	E	A	G	E	W	Q	D	I	Q	Q	L	G	E	C	S	H	.	.	.	.	.	L	M	F	D	F	V	C	N	H	M	S	A	K	S	E	W	F	K	N	Y	L	Q	.	.	Q	H	P	G	F	E	D	F	F	I	A	V	D	P	Q	T	D	L
Query Conservation																																			.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.																							.	.																	.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		A	P	S	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	I	D	P	H	F	G	D	K	E	T	L	K	T	L	V	K	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y	E	F	A	P	F	Q	D	V	L	K	N	G	A	A	S	R	Y	K	D	W	F	H	I	R	E	F	P	L	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S	S	T	T	S		S		T	T	S	B		T	T	T																	T										S	B			T	T											G	G	G		T	T	G	G	G	B		B	S	S	S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		S	A	V	T	R	P	R	A	L	P	L	L	T	P	F	Q	M	R	D	H	S	T	R	H	L	W	T	T	F	S	D	D	Q	I	D	L	N	Y	R	S	P	E	V	L	L	A	M	V	D	V	L	L	C	Y	L	.	A	K	G	A	E	Y	V	R	L	D	A	V	G	F	M	W	K	E	P	G	T	S	C	I
Query Conservation																																																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	H	M	P	K	L	N	T	A	H	P	E	V	K	R	Y	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		H	L	E	K	T	H	L	I	I	K	L	L	R	S	I	I	D	N	V	A	P	G	T	V	I	I	T	E	T	N	V	P	H	K	D	N	I	A	Y	F	G	A	G	D	D	E	A	H	M	V	Y	Q	F	S	L	P	P	L	V	L	H	A	V	Q	K	Q	.	.	N	V	E	A	L	C	A	W	A	Q	N	L
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	H	Q	F	W	R	E	F	R	Q	A	V	K	A	L	K	P	D	V	Y	I	L	G	L	I	W	H	D	A	M	P	W	L	R	.	.	.	.	.	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	L	A	D	A	A	L	R	F	F	A	K	E	D	M	S	A	S	E	F	A	D	R	L	M	H	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																	T	T								S	S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	T	T	S		S			B													T	S			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
						334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.						.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330				.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.
Query SS confidence											.	.	.
Query Sequence		T	L	P	S	S	N	T	T	W	.	.	.	F	N	F	L	A	S	H	D	G	I	G	L	N	P	L	R	G	L	L	P	E	S	E	I	L	E	L	V	E	A	L	Q	Q	E	G	A	L	V	N	W	K	N	N	P	D	G	T	R	S	P	Y	E	I	N	V	T	Y	M	D	A	L	S	R	R	E	S	S	D
Query Conservation											.	.	.
Alig confidence											.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	H	S	Y	P	K	Q	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	P	R	L	L	T	V	C	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	S							T		B		B	S			S	S	S								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	R	C	A	R	F	I	L	A	H	A	I	L	L	S	F	P	G	V	P	A	I	Y	I	Q	S	I	L	G	S	R	N	D	Y	A	G	V	E	K	L	G	Y	N	R	A	I	N	R	K	K	Y	H	S	K	E	I	T	R	E	L	N	D	E	A	T	L	R	H	A	V	Y	H	E	L	S	R	L	I	T
Query Conservation
Alig confidence		.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	G	D	V	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	D	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	Q	N	K	E	L	Y	E	H	V	K	Q	L	I	A
Template Known Secondary structure		.	T														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	G	G	G							T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.										.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.									480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500		.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530					.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.					.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																															.	.	.	.																	.	.	.	.
Query SS confidence																								.																															.	.	.	.																	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	R	S	H	N	E	F	H	P	D	N	N	F	T	I	D	T	I	N	S	S	.	V	M	R	I	P	R	S	N	A	D	G	N	C	L	T	G	L	F	N	V	S	K	N	I	Q	H	V	N	I	T	.	.	.	.	N	L	H	G	R	D	L	I	S	E	V	D	I	L	G	N	.	.	.	.	E	I	T
Query Conservation																								.																															.	.	.	.																	.	.	.	.
Alig confidence																								.									.																						.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		L	R	K	Q	Y	R	A	L	R	R	G	D	V	A	F	L	T	A	D	D	E	V	N	H	L	V	Y	A	K	T	D	.	G	N	E	T	V	M	I	I	I	N	R	S	N	E	A	A	E	I	P	M	P	I	D	A	R	G	K	W	L	V	N	L	L	T	G	E	R	F	A	A	E	A	E	T	L	C	V	S
Template Known Secondary structure					T							S	B			B				S	S		T	T									.	T	T										S	S	S										T	T							T	T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.		.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	P	W	Q	V	M	W	I	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	P	P	Y	G	F	V	L	Y	A
Template Known Secondary structure				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.