Job Description Q46925 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 12:35:54 GMT 2012 Rank 224 Aligned Residues 348 % Identity 17% Template d2v1pa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 1.9

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																.	.	.
Query SS confidence																.	.	.
Query Sequence		P	A	L	Q	D	A	G	V	Y	L	D	S	A	A	.	.	.	T	A	L	K	P	E	A	V	V	E	A	T	Q	Q	F	Y	S	L	S	A	G	N	V	H	R	S	Q	F	A	E	A	Q	R	L	T	A	R	Y	E	A	A	R	E	K	V	A	Q	L	L	N	A	P	D	D	K	T	I	V	W	T	R	G	T
Query Conservation																.	.	.
Alig confidence																.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Sequence		F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	F	S	G	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	G	Y	.	.	.	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G
Template Known Secondary structure		G	G	S		G	G	G		S				S			T	T		S										T	T	S					S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T			.	.	.	S							S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template SS confidence
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.														.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.				.	.	.	.	.	.	100	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120						.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.											.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	E	S	I	N	M	V	A	Q	C	Y	A	R	P	R	L	Q	P	G	D	E	I	I	V	S	V	A	E	H	H	.	.	.	.	.	A	N	L	V	P	W	L	M	V	A	Q	Q	T	G	A	K	V	V	K	L	P	L	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	L	P	D	V	D	L	L	P	E
Query Conservation																																.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.												.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	.	.	.	.	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R
Template Known Secondary structure		T	T	T													.	.	.	.								T	T	T						S	S												T	T							B		T	T	T	T		T	T	S			T	T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.					.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		156	.	.	.					160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.					.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	T	P	.	.	.	.	R	S	R	I	L	A	L	G	Q	M	S	N	V	T	G	.	.	.	.	G	C	P	D	L	A	R	A	I	T	F	A	H	S	A	G	M	V	V	M	V	D	G	A	Q	G	A	V	H	F	P	A	D	V	Q	Q	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y
Template Known Secondary structure								G	G	G								S	S	B		G	G	G		B																	T	T								T	T													G	G	G	T	T	S										G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
				213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																								.
Query SS confidence		.	.																								.
Query Sequence		.	.	I	D	F	Y	A	F	S	G	H	K	L	Y	G	P	T	G	I	G	V	L	Y	G	K	.	S	E	L	L	E	A	M	S	P	W	L	G	G	G	K	M	V	H	E	V	S	F	D	G	F	T	T	Q	S	A	P	W	K	L	E	A	G	T	P	N	V	A	G	V	I	G	L	S	A	A	L	E	W	L
Query Conservation		.	.																								.
Alig confidence		.	.																								.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G
Template Known Secondary structure		G	G		S						S	S	S	T	T			S	S								S	G	G	G												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S																					T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.															.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.					.	.	.	.	.	.	.	340							.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	Y	D	I	N	Q	A	E	S	W	S	R	S	L	A	T	L	A	E	D	A	L	A	K	R	P	G	F	R	S	F	R	C	Q	D	S	S	L	L	A	F	D	.	.	.	.	F	A	G	V	H	H	S	D	.	.	.	.	.	.	M	V	T	L	L	A	E	Y	G	I	A	L	R	A	G	Q	H	C	A
Query Conservation																																													.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																										.	.	.											.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		M	N	.	.	.	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	Q	.	.	.	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L
Template Known Secondary structure		T		.	.	.																					T	T				.	.	.				S	S										S	T	T	S		G	G	G																						S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		326	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.				.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.						370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.												.
Query SS confidence												.	.	.	.	.												.
Query Sequence		Q	P	L	L	A	E	L	G	V	T	.	.	.	.	.	G	T	L	R	A	S	F	A	P	Y	N	.	T	K	S	D	V	D	A	L	V	N	A	V	D	R	A	L	E	L	L	V	D
Query Conservation												.	.	.	.	.												.
Alig confidence												.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N
Template Known Secondary structure				B		T	T	T		S	B				S										T	T	T																			T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.