Job Description Q46925 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 12:35:54 GMT 2012 Rank 139 Aligned Residues 343 % Identity 16% Template d1c4ka2 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Ornithine decarboxylase major domain Resolution 2.70

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.					.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.
Query Sequence		A	A	T	A	L	K	P	E	A	V	V	E	A	T	Q	Q	F	Y	S	L	S	A	G	N	V	H	R	S	Q	F	A	E	A	.	.	.	.	Q	R	L	T	A	R	Y	E	A	A	R	E	K	V	A	Q	L	L	N	A	P	D	D	K	T	I	V	W	T	R	G	T	T	E	S	I	N	M	V	A	Q	C	Y
Query Conservation																																			.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.																					.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		G	G	Q	Y	Y	R	K	H	P	A	G	R	E	F	Y	D	F	F	G	E	T	V	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	L	G	D	L	L	I	H	E	G	P	A	V	A	A	E	K	H	A	A	R	V	Y	N	A	.	.	D	K	T	Y	F	V	L	G	G	S	S	N	A	N	N	T	V	T	S	A	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	G	G	G	S												S					S				T	T	S	G	G	G		B	T	T	T	T	B	T													T	T		.	.	S						S	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	P	R	L	Q	P	G	D	E	I	I	V	S	V	A	E	H	H	A	N	L	V	P	W	L	M	V	A	Q	Q	T	G	A	K	V	V	K	L	P	L	N	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	P	D	V	D	L	L	P	E	L	I	T	P	R	S
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																									.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	V	S	N	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	V	Y	N	S	A	L	A	M	.	.	.	A	G	G	R	P	V	Y	L	Q	T	N	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	Y	D	S	D	F	D	E	K	K	I	R	E	L	A	A	K	V	D	P	E	R	A	K	W	K	R	P	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			T	T							T	T										T	T	T	.	.	.	T													T	T								G	G	G	S									T	T	T	S	S					T		S			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.				.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.														200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		R	I	L	A	L	G	Q	M	S	N	V	T	G	G	C	P	D	L	A	R	A	I	T	F	A	H	S	A	G	M	V	V	M	V	D	G	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	V	H	F	P	A	D	V	Q	Q	L	D	I	D	F	Y	A	F	S	G	H	K	.	L	Y	G	P	T
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Alig confidence										.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation										.
Template Sequence		R	L	A	V	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	H	E	V	V	K	R	I	G	H	L	C	D	Y	I	E	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	R	N	S	S	P	L	L	I	D	D	L	G	P	E	D	P	G	I	I	V	V	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S
Template Known Secondary structure		S						S	B	.		T	T	S													G	G	G	B	S							T	T			G	G	G	S	S	G	G	G	G	G	G		T	T	S						T	T	S													S	S			T
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	G	V	L	Y	G	K	S	E	L	L	E	A	M	S	P	W	L	G	G	G	K	M	V	H	E	V	S	F	D	G	F	T	T	Q	S	A	P	W	K	L	E	A	G	T	P	N	V	A	G	V	I	G	L	S	A	A	L	E	W	L	A	D	Y	D	I	N	Q	A	E	S	W	S	R	S	L	A	T	L
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	L	R	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	K	H	F	N	N	S	F	N	L	F	M	S	T	S	P	F	Y	P	M	Y	A	A	L	D	V	N	A	A	M	Q	E	G	E	A	G	R	K	L	W	H	D	L	L	I	T	T	I	E
Template Known Secondary structure		T									G	G	G	T	T	S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S		S	S																	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380												.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	D	A	L	A	K	R	P	G	F	R	S	F	R	C	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	S	L	L	A	F	D	F	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	K	K	L	I	K	A	G	S	M	F	R	P	F	V	P	P	V	V	N	G	K	K	W	E	D	G	D	T	E	D	M	A	N	N	I	D	Y	W	R	F	E	K	G	A	K	W	H	A	Y	E	G	Y	G	D	N	Q	Y	Y	V	D	P	N	K	F	M	L	T	T	P	G	I	N	P	E	T	G	D	Y
Template Known Secondary structure									T	T		S	S			S	S		S			T	T			G	G	G	S						T	T		G	G	G	G	B			T	T		T	T	T			T	T			T	T						T	T							S	S			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
						336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	V	H	H	S	D	M	V	T	L	L	A	E	Y	G	I	A	L	R	A	G	Q	H	C	A	Q	P	L	L	A	E	L	G	V	T	G	T	L	R	A	S	F	A	P	Y	N	T	K	S	D	V	D	A	L	V	N	A	V	D	R	A	L	E	L	L	V	D
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	F	G	V	P	A	T	I	V	A	N	Y	L	R	D	H	G	I	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	S	D	L	N	S	I	L	F	L	M	T	P	A	E	T	P	A	K	M	N	N	L	I	T	Q	L	L	Q	L	Q	R	L	I	E	E
Template Known Secondary structure			S	S														T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S								T	T																						T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.													.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.