Job Description Q46925 Confidence 99.79% Date Thu Jan 5 12:35:54 GMT 2012 Rank 226 Aligned Residues 347 % Identity 16% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.
Query SS confidence														.	.	.
Query Sequence		L	Q	D	A	G	V	Y	L	D	S	A	A	.	.	.	T	A	L	K	P	E	A	V	V	E	A	T	Q	Q	F	Y	S	L	S	A	G	N	V	H	R	S	Q	F	A	E	A	Q	R	L	T	A	R	Y	E	A	A	R	E	K	V	A	Q	L	L	N	A	P	D	D	K	T	I	V	W	T	R	G	T	T	E
Query Conservation														.	.	.
Alig confidence														.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Sequence		L	P	S	S	A	V	Y	I	D	L	L	T	D	S	G	T	N	A	M	S	D	H	Q	W	A	A	M	I	T	G	D	E	A	Y	A	G	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	Y	D	L	K	D	K	A	K	E	L	F	N	Y	.	.	.	D	Y	I	I	P	A	H	Q	G	R	G
Template Known Secondary structure		S		G	G	G		S				S		S	S	S														T					S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.							S	S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template SS confidence
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.														.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.				.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.				.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.											.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	N	M	V	A	Q	C	Y	A	R	P	R	L	.	.	.	Q	P	G	D	E	I	I	V	S	V	A	E	H	H	A	N	L	V	P	W	L	M	V	A	Q	Q	T	G	A	K	V	V	K	L	P	L	N	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	P	D	V	D	L	L	P	E	L	I	T	P
Query Conservation																.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.																						.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.
Template Sequence		A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	G	K	A	K	N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	.	.	.	.	L	N	G	C	K	A	I	N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T	Y	D	D	W	K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q
Template Known Secondary structure																	T	T			S	S						S	S											.	.	.	.		T	T							B		G	G	G	G		T	T	S			T	T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140					.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
						160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.					.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																		.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	R	S	R	I	L	A	L	G	Q	M	S	N	V	T	G	.	.	.	.	G	C	P	D	L	A	R	A	I	T	F	A	H	S	A	G	M	V	V	M	V	D	G	A	Q	G	A	V	H	F	P	A	D	V	Q	Q	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D
Query Conservation		.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	G	A	D	N	I	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	I	F	V	V	M	D	S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P	K	Y	K	N	A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D
Template Known Secondary structure				G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T								T	T													G	G	G	T	T											G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	A	F	S	G	H	K	L	Y	G	P	T	G	I	G	V	L	Y	G	K	S	E	L	L	E	A	M	S	P	W	L	G	G	G	K	M	V	H	E	V	S	F	D	G	F	T	T	Q	S	A	P	W	K	L	E	A	G	T	P	N	V	A	G	V	I	G	L	S	A	A	L	E	W	L	A	D	Y	D	I
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	N	I	G	G	L	V	A	I	R	D	N	E	E	I	F	T	L	A	R	Q	R	C	V	P	M	E	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T	E
Template Known Secondary structure													S	S							S	S																T		S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.										.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Query Sequence		N	Q	A	E	S	W	S	R	S	L	A	T	L	A	E	D	A	L	A	K	R	P	G	F	R	S	F	R	C	Q	D	S	S	L	L	A	F	D	F	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	H	S	D	M	V	T	L	L	.	A	E	Y	G	I	A	L	R	A	G	Q	H	C	A	Q	P	L	L	A
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Alig confidence																							.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																							.
Template Sequence		E	E	Y	L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	.	G	I	P	I	Q	Y	P	T	G	G	H	A	V	F	V	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P
Template Known Secondary structure																						T	.	T			B		S	S			S	S						S	T	T	T		T	T	S		G	G	G																						S						B		T
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		365	.	.	.	.						370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.												.
Query SS confidence							.	.	.	.	.												.
Query Sequence		E	L	G	V	T	.	.	.	.	.	G	T	L	R	A	S	F	A	P	Y	N	.	T	K	S	D	V	D	A	L	V	N	A	V	D	R	A	L	E	L	L	V	D
Query Conservation							.	.	.	.	.												.
Alig confidence							.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	G	E	Q	K	H	A	D	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y	T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A	T
Template Known Secondary structure		T	T		S	B				S										T	T	S	S														T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.