Job Description P33916 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:44 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 435 % Identity 19% Template c2iw3B_ PDB info PDB header:translation Chain: B: PDB Molecule:elongation factor 3a; PDBTitle: elongation factor 3 in complex with adp Resolution 2.4 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	I	E	N	L	S	V	G	F	R	H	Q	Q	T	V	R	T	V	V	N	D	V	S	L	Q	I	E	A	G	E	T	L	A	L	V	G	E	S	G	S	G	K	S	V	T	A	L	S	I	L	R	L	L	P	S	P	P	V	E	Y	L	S	G	D	I	R	F	H	G	E	S	L	L	H	A	S	D	Q	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	C	N	C	E	F	S	L	A	Y	.	.	.	.	G	A	K	I	L	L	N	K	T	Q	L	R	L	K	R	A	R	R	Y	G	I	C	G	P	N	G	C	G	K	S	T	L	X	R	A	I	A	N	G	Q	V	D	G	F	P	T	Q	E	E	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	T	T													T	T								S	T	T	S	S										T	T		S	T	T				T	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.					440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	G	V	R	G	N	K	I	A	M	I	F	Q	E	P	M	V	S	L	N	P	L	H	T	L	E	K	Q	L	Y	E	V	L	S	L	H	R	G	M	R	R	E	A	A	R	G	E	I	L	N	C	L	D	R	V	G	I	R	Q	A	A	K	R	L	T	D	Y	P	H	Q	L	S	G	G	E	R	Q	R	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	R	T	V	Y	V	E	H	D	I	D	G	T	H	S	D	T	S	V	L	D	F	V	F	E	S	G	V	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	A	I	K	D	K	L	I	E	F	G	F	T	D	E	.	.	X	I	A	X	P	I	S	A	L	S	G	G	W	K	X	K	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.					T	T								T	T	S	B							T	T			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.												T					.	.				S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
									490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.										.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.			.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.		.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.
Query SS confidence																																																																										.
Query Sequence		M	I	A	M	A	L	L	T	R	P	E	L	L	I	A	D	E	P	T	T	A	L	D	V	S	V	Q	A	Q	I	L	Q	L	L	R	E	L	Q	G	E	L	N	M	G	M	L	F	I	T	H	N	L	S	I	V	R	K	L	A	H	R	V	A	V	M	Q	N	G	R	C	V	E	.	Q	N	Y	A	A	T	L
Query Conservation																																																																										.
Alig confidence																																							.	.	.	.																																.
Template Conservation																																							.	.	.	.
Template Sequence		A	L	A	R	A	V	L	R	N	A	D	I	L	L	L	D	E	P	T	N	H	L	D	T	V	N	V	A	W	L	V	N	Y	L	N	T	C	.	.	.	.	G	I	T	S	I	T	I	S	H	D	S	V	F	L	D	N	V	C	E	Y	I	I	N	Y	E	G	L	K	L	R	K	Y	K	G	N	F	T	E	F
Template Known Secondary structure									T	T		S						S	T	T	T	T																S	.	.	.	.		S							S										S							T	T							S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.					.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.								.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	A	S	P	T	H	P	Y	T	Q	K	L	L	N	S	E	P	S	G	D	P	V	P	L	.	.	.	.	.	.	.	P	E	P	A	S	T	L	L	D	V	E	Q	L	Q	V	A	F	P	I	R	K	G	I	L	K	R	I	V	D	H	N	V	V	V	K	N	I	S	F	T	L	R	A	G	E	T	L	G	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	K	C	P	A	A	K	A	Y	E	E	L	S	N	T	D	L	E	F	K	F	P	E	P	G	Y	L	E	G	V	K	T	K	Q	K	A	I	V	K	V	T	N	X	E	F	Q	Y	P	G	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	Q	I	T	D	I	N	F	Q	C	S	L	S	S	R	I	A	V
Template Known Secondary structure						G	G	G	G	G	T	T		S	S	G	G	G	G											T	T			S	T	T	S		S											T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.										680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																																																												.
Query SS confidence																					.																																																												.
Query Sequence		V	G	E	S	G	S	G	K	S	T	T	G	L	A	L	L	R	L	I	.	N	S	Q	G	S	I	I	F	D	G	Q	P	L	Q	N	L	N	R	R	Q	L	L	P	I	R	H	R	I	Q	V	V	F	Q	D	P	N	S	S	L	N	P	R	L	N	V	L	Q	I	I	E	E	G	L	R	V	H	Q	P	T	.
Query Conservation																					.																																																												.
Alig confidence																					.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	P	N	G	A	G	K	S	T	L	I	N	V	L	T	G	E	L	L	P	T	S	G	E	V	Y	T	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	C	R	I	A	Y	I	K	Q	H	A	F	A	H	I	E	S	H	L	D	K	T	P	S	E	Y	I	Q	W	R	F	Q	T	G	E	D
Template Known Secondary structure			S	S													T	T	S	S			S								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T														G	G	G		T	T	S										T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.															.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	T	X	D	R	A	N	R	Q	I	N	E	N	D	A	E	A	X	N	K	I	F	K	I	E	G	T	P	R	R	I	A	G	I	H	S	R	R	K	F	K	N	T	Y	E	Y	E	C	S	F	L	L	G	E	N	I	G	X	K	S	E	R	W	V	P	X	X	S	V	D	N	A	W	I	P	R	G	E	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T	T	S					S	S		S	S	S	T	T						T	T															T	T													S	S	S	S	T	T								G	G	G						G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		765	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.
																						396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	A	A	Q	R	E	Q	Q	V	I	A	V	M	H	E	V	G	L	D	P	E	T	R	.	H	R	Y	P	A	E	F	S	G	G	Q	R	Q	R	I	A	I	A	R	A	L	I	L	K	P	S	L	I	I	L	D	E	P	T	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	S	H	S	K	X	V	A	E	V	D	X	K	E	A	L	A	S	G	Q	F	R	P	L	T	R	K	E	I	E	E	H	C	S	X	L	G	L	D	P	E	I	V	S	H	S	R	I	R	G	L	S	G	G	Q	K	V	K	L	V	L	A	A	G	T	W	Q	R	P	H	L	I	V	L	D	E	P	T	N
Template Known Secondary structure																				T	T																	T	T									S		G	G	G	S														T	T	T			S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		845	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	D	K	T	V	Q	A	Q	I	L	T	L	L	K	S	L	Q	Q	K	H	Q	L	A	Y	L	F	I	S	H	D	L	H	V	V	R	A	L	C	H	Q	V	I	I	L	R	Q	G	E	V	V	E	Q	G	P
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	D	R	D	S	L	G	A	L	S	K	A	L	.	.	.	.	K	E	F	E	G	G	V	I	I	I	T	H	S	A	E	F	T	K	N	L	T	E	E	V	W	A	V	K	D	G	R	X	T	P	S	G	H
Template Known Secondary structure		T														.	.	.	.				S	S							S						T	T	T								B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.
Template SS confidence
		925	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.					.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.