Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75764 Date Thu Jan 5 12:13:53 GMT 2012 Unique Job ID ffd62f2f397f0755

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	K	L	S	E	K	G	V	F	L	A	S	N	N	E	I	I	A	E	E	H	F	T	G	E	I	K	K	E	E	A	K	K	G	T	I	A	W	S	I	L	S	S	H	N	T	S	G	N	M	D	K	L	K	I	K	F	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	A	S	H	D	I	T	F	V	G	I	V	Q	T	A	K	A	S	G	M	E	R	F	P	L	P	Y	V	L	T	N	C	H	N	S	L	C	A	V	G	G	T	I	N	G	D	D	H	V	F	G	L	S	A	A	Q	R	Y	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	F	V	P	P	H	I	A	V	I	H	Q	Y	M	R	E	M	M	A	G	G	G	K	M	I	L	G	S	D	S	H	T	R	Y	G	A	L	G	T	M	A	V	G	E	G	G	G	E	L	V	K	Q	L	L	N	D	T	W	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	Y	P	G	V	V	A	V	H	L	T	G	K	P	A	P	Y	V	G	P	Q	D	V	A	L	A	I	I	G	A	V	F	K	N	G	Y	V	K	N	K	V	M	E	F	V	G	P	G	V	S	A	L	S	T	D	F	R	N	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	V	M	T	T	E	T	T	C	L	S	S	V	W	Q	T	D	E	E	V	H	N	W	L	A	L	H	G	R	G	Q	D	Y	C	Q	L	N	P	Q	P	M	A	Y	Y	D	G	C	I	S	V	D	L	S	A	I	K	P	M	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	P	F	H	P	S	N	V	Y	E	I	D	T	L	N	Q	N	L	T	D	I	L	R	E	I	E	I	E	S	E	R	V	A	H	G	K	A	K	L	S	L	L	D	K	V	E	N	G	R	L	K	V	Q	Q	G	I	I	A	G	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	G	G	N	Y	E	N	V	I	A	A	A	N	A	L	R	G	Q	S	C	G	N	D	T	F	S	L	A	V	Y	P	S	S	Q	P	V	F	M	D	L	A	K	K	G	V	V	A	D	L	I	G	A	G	A	I	I	R	T	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		C	G	P	C	F	G	A	G	D	T	P	I	N	N	G	L	S	I	R	H	T	T	R	N	F	P	N	R	E	G	S	K	P	A	N	G	Q	M	S	A	V	A	L	M	D	A	R	S	I	A	A	T	A	A	N	G	G	Y	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	A	S	E	L	D	C	W	D	N	V	P	E	Y	A	F	D	V	T	P	Y	K	N	R	V	Y	Q	G	F	V	K	G	A	T	Q	Q	P	L	I	Y	G	P	N	I	K	D	W	P	E	L	G	A	L	T	D	N	I	V	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		V	C	S	K	I	L	D	E	V	T	T	T	D	E	L	I	P	S	G	E	T	S	S	Y	R	S	N	P	I	G	L	A	E	F	T	L	S	R	R	D	P	G	Y	V	S	R	S	K	A	T	A	E	L	E	N	Q	R	L	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?																							?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	V	S	E	L	T	E	V	F	A	R	I	K	Q	I	A	G	Q	E	H	I	D	P	L	Q	T	E	I	G	S	M	V	Y	A	V	K	P	G	D	G	S	A	R	E	Q	A	A	S	C	Q	R	V	I	G	G	L	A	N	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	E	Y	A	T	K	R	Y	R	S	N	V	I	N	W	G	M	L	P	L	Q	M	A	E	V	P	T	F	E	V	G	D	Y	I	Y	I	P	G	I	K	A	A	L	D	N	P	G	T	T	F	K	G	Y	V	I	H	E	D	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
Sequence		V	T	E	I	T	L	Y	M	E	S	L	T	A	E	E	R	E	I	I	K	A	G	S	L	I	N	F	N	K	N	R	Q	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand