Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGM9 Date Thu Jan 5 11:29:35 GMT 2012 Unique Job ID ff3b70a26b477d42

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	V	S	T	L	E	S	E	N	A	Q	P	V	A	Q	T	Q	N	S	E	L	I	Y	R	L	E	D	R	P	P	L	P	Q	T	L	F	A	A	C	Q	H	L	L	A	M	F	V	A	V	I	T	P	A	L	L	I	C	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	G	L	P	A	Q	D	T	Q	H	I	I	S	M	S	L	F	A	S	G	V	A	S	I	I	Q	I	K	A	W	G	P	V	G	S	G	L	L	S	I	Q	G	T	S	F	N	F	V	A	P	L	I	M	G	G	T	A	L	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	G	A	D	V	P	T	M	M	A	A	L	F	G	T	L	M	L	A	S	C	T	E	M	V	I	S	R	V	L	H	L	A	R	R	I	I	T	P	L	V	S	G	V	V	V	M	I	I	G	L	S	L	I	Q	V	G	L	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	G	G	G	Y	A	A	M	S	D	N	T	F	G	A	P	K	N	L	L	L	A	G	V	V	L	A	L	I	I	L	L	N	R	Q	R	N	P	Y	L	R	V	A	S	L	V	I	A	M	A	A	G	Y	A	L	A	W	F	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?																									?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	L	P	E	S	N	E	P	M	T	Q	E	L	I	M	V	P	T	P	L	Y	Y	G	L	G	I	E	W	S	L	L	L	P	L	M	L	V	F	M	I	T	S	L	E	T	I	G	D	I	T	A	T	S	D	V	S	E	Q	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?					?	?																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	G	P	L	Y	M	K	R	L	K	G	G	V	L	A	N	G	L	N	S	F	V	S	A	V	F	N	T	F	P	N	S	C	F	G	Q	N	N	G	V	I	Q	L	T	G	V	A	S	R	Y	V	G	F	V	V	A	L	M	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																						?		?		?	?	?	?										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	L	G	L	F	P	A	V	S	G	F	V	Q	H	I	P	E	P	V	L	G	G	A	T	L	V	M	F	G	T	I	A	A	S	G	V	R	I	V	S	R	E	P	L	N	R	R	A	I	L	I	I	A	L	S	L	A	V	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Sequence		G	V	S	Q	Q	P	L	I	L	Q	F	A	P	E	W	L	K	N	L	L	S	S	G	I	A	A	G	G	I	T	A	I	V	L	N	L	I	F	P	P	E	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?																		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand