Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AG24 Date Thu Jan 5 11:27:55 GMT 2012 Unique Job ID fdb762c2dbd95496

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	L	F	E	S	L	N	Q	L	I	Q	T	Y	L	P	E	D	Q	I	K	R	L	R	Q	A	Y	L	V	A	R	D	A	H	E	G	Q	T	R	S	S	G	E	P	Y	I	T	H	P	V	A	V	A	C	I	L	A	E	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	D	Y	E	T	L	M	A	A	L	L	H	D	V	I	E	D	T	P	A	T	Y	Q	D	M	E	Q	L	F	G	K	S	V	A	E	L	V	E	G	V	S	K	L	D	K	L	K	F	R	D	K	K	E	A	Q	A	E	N	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	M	I	M	A	M	V	Q	D	I	R	V	I	L	I	K	L	A	D	R	T	H	N	M	R	T	L	G	S	L	R	P	D	K	R	R	R	I	A	R	E	T	L	E	I	Y	S	P	L	A	H	R	L	G	I	H	H	I	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	L	E	E	L	G	F	E	A	L	Y	P	N	R	Y	R	V	I	K	E	V	V	K	A	A	R	G	N	R	K	E	M	I	Q	K	I	L	S	E	I	E	G	R	L	Q	E	A	G	I	P	C	R	V	S	G	R	E	K	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	S	I	Y	C	K	M	V	L	K	E	Q	R	F	H	S	I	M	D	I	Y	A	F	R	V	I	V	N	D	S	D	T	C	Y	R	V	L	G	Q	M	H	S	L	Y	K	P	R	P	G	R	V	K	D	Y	I	A	I	P	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	G	Y	Q	S	L	H	T	S	M	I	G	P	H	G	V	P	V	E	V	Q	I	R	T	E	D	M	D	Q	M	A	E	M	G	V	A	A	H	W	A	Y	K	E	H	G	E	T	S	T	T	A	Q	I	R	A	Q	R	W	M	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	L	L	E	L	Q	Q	S	A	G	S	S	F	E	F	I	E	S	V	K	S	D	L	F	P	D	E	I	Y	V	F	T	P	E	G	R	I	V	E	L	P	A	G	A	T	P	V	D	F	A	Y	A	V	H	T	D	I	G	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		C	V	G	A	R	V	D	R	Q	P	Y	P	L	S	Q	P	L	T	S	G	Q	T	V	E	I	I	T	A	P	G	A	R	P	N	A	A	W	L	N	F	V	V	S	S	K	A	R	A	K	I	R	Q	L	L	K	N	L	K	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?																?	?	?	?	?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	S	V	S	L	G	R	R	L	L	N	H	A	L	G	G	S	R	K	L	N	E	I	P	Q	E	N	I	Q	R	E	L	D	R	M	K	L	A	T	L	D	D	L	L	A	E	I	G	L	G	N	A	M	S	V	V	V	A	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	Q	H	G	D	A	S	I	P	P	A	T	Q	S	H	G	H	L	P	I	K	G	A	D	G	V	L	I	T	F	A	K	C	C	R	P	I	P	G	D	P	I	I	A	H	V	S	P	G	K	G	L	V	I	H	H	E	S	C	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	I	R	G	Y	Q	K	E	P	E	K	F	M	A	V	E	W	D	K	E	T	A	Q	E	F	I	T	E	I	K	V	E	M	F	N	H	Q	G	A	L	A	N	L	T	A	A	I	N	T	T	T	S	N	I	Q	S	L	N	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?													?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.
Sequence		E	K	D	G	R	V	Y	S	A	F	I	R	L	T	A	R	D	R	V	H	L	A	N	I	M	R	K	I	R	V	M	P	D	V	I	K	V	T	R	N	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																										?	?	?		?						?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand