Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P43676 Date Thu Jan 5 12:02:30 GMT 2012 Unique Job ID fd5d3ed7605aeb3c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	N	L	F	V	G	L	D	I	Y	T	G	L	L	L	L	L	A	L	A	F	V	L	F	Y	E	A	I	N	G	F	H	D	T	A	N	A	V	A	A	V	I	Y	T	R	A	M	Q	P	Q	L	A	V	V	M	A	A	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	F	F	G	V	L	L	G	G	L	S	V	A	Y	A	I	V	H	M	L	P	T	D	L	L	L	N	M	G	S	T	H	G	L	A	M	V	F	S	M	L	L	A	A	I	I	W	N	L	G	T	W	F	F	G	L	P	A	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	H	T	L	I	G	A	I	I	G	I	G	L	T	N	A	L	L	T	G	S	S	V	M	D	A	L	N	L	R	E	V	T	K	I	F	S	S	L	I	V	S	P	I	V	G	L	V	I	A	G	G	L	I	F	L	L	R	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	S	G	T	K	K	R	D	R	I	H	R	I	P	E	D	R	K	K	K	K	G	K	R	K	P	P	F	W	T	R	I	A	L	I	V	S	A	A	G	V	A	F	S	H	G	A	N	D	G	Q	K	G	I	G	L	V	M	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	V	G	I	A	P	A	G	F	V	V	N	M	N	A	S	G	Y	E	I	T	R	T	R	D	A	V	T	N	F	E	H	Y	L	Q	Q	H	P	E	L	P	Q	K	L	I	A	M	E	P	P	L	P	A	A	S	T	D	G	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?			?		?		?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	T	E	F	H	C	H	P	A	N	T	F	D	A	I	A	R	V	K	T	M	L	P	G	N	M	E	S	Y	E	P	L	S	V	S	Q	R	S	Q	L	R	R	I	M	L	C	I	S	D	T	S	A	K	L	A	K	L	P	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?		?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	K	E	D	Q	N	L	L	K	K	L	R	S	D	M	L	S	T	I	E	Y	A	P	V	W	I	I	M	A	V	A	L	A	L	G	I	G	T	M	I	G	W	R	R	V	A	M	T	I	G	E	K	I	G	K	R	G	M	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?																																		?		?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	Q	G	M	A	A	Q	M	T	A	A	V	S	I	G	L	A	S	Y	I	G	M	P	V	S	T	T	H	V	L	S	S	A	V	A	G	T	M	V	V	D	G	G	G	L	Q	R	K	T	V	T	S	I	L	M	A	W	V	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																	?					?													?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	P	A	A	I	F	L	S	G	G	L	Y	W	I	A	L	Q	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand