Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P54745 Date Thu Jan 5 12:06:03 GMT 2012 Unique Job ID fcdb342c9470a1b6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	L	F	Y	R	A	H	W	R	D	Y	K	N	D	Q	V	R	I	M	M	N	L	T	T	L	T	H	R	D	A	L	C	L	N	A	R	F	T	S	R	E	E	A	I	H	A	L	T	Q	R	L	A	A	L	G	K	I	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	E	Q	F	L	E	E	V	Y	R	R	E	S	L	G	P	T	A	L	G	E	G	L	A	V	P	H	G	K	T	A	A	V	K	E	A	A	F	A	V	A	T	L	S	E	P	L	Q	W	E	G	V	D	G	P	E	A	V	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?																																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	V	L	L	A	I	P	P	N	E	A	G	T	T	H	M	Q	L	L	T	A	L	T	T	R	L	A	D	D	E	I	R	A	R	I	Q	S	A	T	T	P	D	E	L	L	S	A	L	D	D	K	G	G	T	Q	P	S	A	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	N	A	P	T	I	V	C	V	T	A	C	P	A	G	I	A	H	T	Y	M	A	A	E	Y	L	E	K	A	G	R	K	L	G	V	N	V	Y	V	E	K	Q	G	A	N	G	I	E	G	R	L	T	A	D	Q	L	N	S	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?																										?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	C	I	F	A	A	E	V	A	I	K	E	S	E	R	F	N	G	I	P	A	L	S	V	P	V	A	E	P	I	R	H	A	E	A	L	I	Q	Q	A	L	T	L	K	R	S	D	E	T	R	T	V	Q	Q	D	T	Q	P	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	V	K	T	E	L	K	Q	A	L	L	S	G	I	S	F	A	V	P	L	I	V	A	G	G	T	V	L	A	V	A	V	L	L	S	Q	I	F	G	L	Q	D	L	F	N	E	E	N	S	W	L	W	M	Y	R	K	L	G	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	L	G	I	L	M	V	P	V	L	A	A	Y	T	A	Y	S	L	A	D	K	P	A	L	A	P	G	F	A	A	G	L	A	A	N	M	I	G	S	G	F	L	G	A	V	V	G	G	L	I	A	G	Y	L	M	R	W	V	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	L	R	L	S	S	K	F	N	G	F	L	T	F	Y	L	Y	P	V	L	G	T	L	G	A	G	S	L	M	L	F	V	V	G	E	P	V	A	W	I	N	N	S	L	T	A	W	L	N	G	L	S	G	S	N	A	L	L	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	I	L	G	F	M	C	S	F	D	L	G	G	P	V	N	K	A	A	Y	A	F	C	L	G	A	M	A	N	G	V	Y	G	P	Y	A	I	F	A	S	V	K	M	V	S	A	F	T	V	T	A	S	T	M	L	A	P	R	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	E	F	E	I	E	T	G	K	S	T	W	L	L	G	L	A	G	I	T	E	G	A	I	P	M	A	I	E	D	P	L	R	V	I	G	S	F	V	L	G	S	M	V	T	G	A	I	V	G	A	M	N	I	G	L	S	T	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	G	I	F	S	L	F	L	L	H	D	N	G	A	G	G	V	M	A	A	I	G	W	F	G	A	A	L	V	G	A	A	I	S	T	A	I	L	L	M	W	R	R	H	A	V	K	H	G	N	Y	L	T	D	G	V	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand