Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77348 Date Thu Jan 5 12:28:03 GMT 2012 Unique Job ID fc4efc98cbad9cd3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	H	S	V	S	V	T	C	C	A	L	L	V	S	S	I	S	L	S	Y	A	A	E	V	P	S	G	T	V	L	A	E	K	Q	E	L	V	R	H	I	K	D	E	P	A	S	L	D	P	A	K	A	V	G	L	P	E	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	R	D	L	F	E	G	L	V	N	Q	N	E	K	G	E	I	V	P	G	V	A	T	Q	W	K	S	N	D	N	R	I	W	T	F	T	L	R	D	N	A	K	W	A	D	G	T	P	V	T	A	Q	D	F	V	Y	S	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	L	V	D	P	K	T	L	S	P	F	A	W	F	A	A	L	A	G	I	N	N	A	Q	A	I	I	D	G	K	A	T	P	D	Q	L	G	V	T	A	V	D	A	H	T	L	K	I	Q	L	D	K	P	L	P	W	F	V	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	N	F	A	F	F	P	V	Q	K	A	N	V	E	S	G	K	E	W	T	K	P	G	N	L	I	G	N	G	A	Y	V	L	K	E	R	V	V	N	E	K	L	V	V	V	P	N	T	H	Y	W	D	N	A	K	T	V	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	V	T	F	L	P	I	N	Q	E	S	A	A	T	K	R	Y	L	A	G	D	I	D	I	T	E	S	F	P	K	N	M	Y	Q	K	L	L	K	D	I	P	G	Q	V	Y	T	P	P	Q	L	G	T	Y	Y	Y	A	F	N	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	G	P	T	A	D	Q	R	V	R	L	A	L	S	M	T	I	D	R	R	L	M	T	E	K	V	L	G	T	G	E	K	P	A	W	H	F	T	P	D	V	T	A	G	F	T	P	E	P	S	P	F	E	Q	M	S	Q	E	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	A	Q	A	K	T	L	L	S	A	A	G	Y	G	P	Q	K	P	L	K	L	T	L	L	Y	N	T	S	E	N	H	Q	K	I	A	I	A	V	A	S	M	W	K	K	N	L	G	V	D	V	K	L	Q	N	Q	E	W	K	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	D	S	R	N	T	G	N	F	D	V	I	R	A	S	W	V	G	D	Y	N	E	P	S	T	F	L	T	L	L	T	S	T	H	S	G	N	I	S	R	F	N	N	P	A	Y	D	K	V	L	A	Q	A	S	T	E	N	T	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?		?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	R	N	A	D	Y	N	A	A	E	K	I	L	M	E	Q	A	P	I	A	P	I	Y	Q	Y	T	N	G	R	L	I	K	P	W	L	K	G	Y	P	I	N	N	P	E	D	V	A	Y	S	R	T	M	Y	I	V	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand