Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24255 Date Thu Jan 5 11:41:39 GMT 2012 Unique Job ID fc499dc3c57a84a9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	Q	G	L	Q	L	R	L	S	Q	Q	L	A	M	T	P	Q	L	Q	Q	A	I	R	L	L	Q	L	S	T	L	E	L	Q	Q	E	L	Q	Q	A	L	E	S	N	P	L	L	E	Q	I	D	T	H	E	E	I	D	T	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	Q	D	S	E	T	L	D	T	A	D	A	L	E	Q	K	E	M	P	E	E	L	P	L	D	A	S	W	D	T	I	Y	T	A	G	T	P	S	G	T	S	G	D	Y	I	D	D	E	L	P	V	Y	Q	G	E	T	T	Q	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	D	Y	L	M	W	Q	V	E	L	T	P	F	S	D	T	D	R	A	I	A	T	S	I	V	D	A	V	D	E	T	G	Y	L	T	V	P	L	E	D	I	L	E	S	I	G	D	E	E	I	D	I	D	E	V	E	A	V	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	I	Q	R	F	D	P	V	G	V	A	A	K	D	L	R	D	C	L	L	I	Q	L	S	Q	F	D	K	T	T	P	W	L	E	E	A	R	L	I	I	S	D	H	L	D	L	L	A	N	H	D	F	R	T	L	M	R	V	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	K	E	D	V	L	K	E	A	V	N	L	I	Q	S	L	D	P	R	P	G	Q	S	I	Q	T	G	E	P	E	Y	V	I	P	D	V	L	V	R	K	H	N	G	H	W	T	V	E	L	N	S	D	S	I	P	R	L	Q	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	H	Y	A	S	M	C	N	N	A	R	N	D	G	D	S	Q	F	I	R	S	N	L	Q	D	A	K	W	L	I	K	S	L	E	S	R	N	D	T	L	L	R	V	S	R	C	I	V	E	Q	Q	Q	A	F	F	E	Q	G	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	M	K	P	M	V	L	A	D	I	A	Q	A	V	E	M	H	E	S	T	I	S	R	V	T	T	Q	K	Y	L	H	S	P	R	G	I	F	E	L	K	Y	F	F	S	S	H	V	N	T	E	G	G	G	E	A	S	S	T	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?			?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	A	L	V	K	K	L	I	A	A	E	N	P	A	K	P	L	S	D	S	K	L	T	S	L	L	S	E	Q	G	I	M	V	A	R	R	T	V	A	K	Y	R	E	S	L	S	I	P	P	S	N	Q	R	K	Q	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																														?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand