Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76236 Date Thu Jan 5 12:21:01 GMT 2012 Unique Job ID fc1e892026277d0d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	Q	S	T	R	I	S	M	G	L	F	F	K	Y	F	L	S	L	T	K	I	D	P	G	Q	N	Y	I	S	L	P	S	I	K	S	S	T	H	I	A	L	L	F	M	V	S	M	G	T	Q	K	L	K	A	Q	S	F	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																								?				?	?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	S	L	L	L	T	L	I	L	F	C	I	T	T	L	Y	N	E	N	T	N	V	K	L	I	P	Q	M	N	Y	L	M	V	V	V	A	L	F	F	L	N	A	V	I	F	L	F	M	L	M	K	Y	F	T	N	K	Q	I	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	I	L	S	L	A	F	L	S	G	L	I	Y	L	V	E	T	I	V	I	I	H	K	P	I	N	G	S	T	L	I	Q	T	K	S	N	D	V	S	I	F	Y	I	F	R	Q	L	S	F	I	C	L	T	S	L	A	L	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	G	K	D	N	I	L	D	N	N	K	K	K	T	G	I	L	L	L	A	L	I	P	F	L	V	F	P	L	L	A	H	N	L	S	S	Y	N	A	D	Y	S	L	Y	V	V	D	Y	C	P	D	N	H	T	A	T	W	G	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?		?	?	?																																										?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	T	K	I	L	V	C	L	W	A	F	L	L	F	F	I	I	M	R	T	R	L	A	S	E	L	W	P	L	I	A	L	L	C	L	A	S	L	C	C	N	L	L	L	L	T	L	D	E	Y	N	Y	T	I	W	Y	I	S	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	E	V	S	S	K	L	F	V	V	S	F	L	I	Y	N	I	F	Q	E	L	Q	L	S	S	K	L	A	V	H	D	V	L	T	N	I	Y	N	R	R	Y	F	F	N	S	V	E	S	L	L	S	R	P	V	V	K	D	F	C	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	L	V	D	I	N	Q	F	K	R	I	N	A	Q	W	G	H	R	V	G	D	K	V	L	V	S	I	V	D	I	I	Q	Q	S	I	R	P	D	D	I	L	A	R	L	E	G	E	V	F	G	L	L	F	T	E	L	N	S	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	K	I	I	A	E	R	M	R	K	N	V	E	L	L	T	G	F	S	N	R	Y	D	V	P	E	Q	M	T	I	S	I	G	T	V	F	S	T	G	D	T	R	N	I	S	L	V	M	T	E	A	D	K	A	L	R	E	A	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Sequence		E	G	G	N	K	V	I	I	H	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand