Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75791 Date Thu Jan 5 12:14:10 GMT 2012 Unique Job ID fac86ab453590ec2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	S	T	F	T	S	D	T	L	P	A	D	H	K	A	A	I	R	Q	M	K	H	A	L	R	A	Q	L	G	D	V	Q	Q	I	F	N	Q	L	S	D	D	I	A	T	R	V	A	E	I	N	A	L	K	A	Q	G	D	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?																												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	P	V	L	S	Y	A	D	I	K	A	G	H	V	T	A	E	Q	R	E	Q	I	K	R	R	G	C	A	V	I	K	G	H	F	P	R	E	Q	A	L	G	W	D	Q	S	M	L	D	Y	L	D	R	N	R	F	D	E	V	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?		?																																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	P	G	D	N	F	F	G	T	L	S	A	S	R	P	E	I	Y	P	I	Y	W	S	Q	A	Q	M	Q	A	R	Q	S	E	E	M	A	N	A	Q	S	F	L	N	R	L	W	T	F	E	S	D	G	K	Q	W	F	N	P	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?																					?				?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	V	I	Y	P	D	R	I	R	R	R	P	P	G	T	T	S	K	G	L	G	A	H	T	D	S	G	A	L	E	R	W	L	L	P	A	Y	Q	R	V	F	A	N	V	F	N	G	N	L	A	Q	Y	D	P	W	H	A	A	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?		?		?				?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	E	V	E	E	Y	T	V	D	N	T	T	K	C	S	V	F	R	T	F	Q	G	W	T	A	L	S	D	M	L	P	G	Q	G	L	L	H	V	V	P	I	P	E	A	M	A	Y	V	L	L	R	P	L	L	D	D	V	P	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?			?										?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	L	C	G	V	A	P	G	R	V	L	P	V	S	E	Q	W	H	P	L	L	I	E	A	L	T	S	I	P	K	L	E	A	G	D	S	V	W	W	H	C	D	V	I	H	S	V	A	P	V	E	N	Q	Q	G	W	G	N	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	I	P	A	A	P	M	C	E	K	N	L	A	Y	A	H	K	V	K	A	A	L	E	K	G	A	S	P	G	D	F	P	R	E	D	Y	E	T	N	W	E	G	R	F	T	L	A	D	L	N	I	H	G	K	R	A	L	G	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand