Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P46855 Date Thu Jan 5 12:04:27 GMT 2012 Unique Job ID fa6487f34d8f26af

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	N	I	V	Y	L	T	V	T	G	E	Q	Q	G	S	I	S	A	G	C	G	T	S	E	S	T	G	N	R	W	Q	S	G	H	E	D	E	I	F	T	F	S	L	L	N	N	I	N	N	T	G	L	G	S	Q	F	H	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	F	C	K	L	I	D	K	S	T	P	L	F	I	N	S	I	N	N	N	E	Q	L	F	M	G	F	D	F	Y	R	I	N	R	F	G	R	L	E	K	Y	Y	Y	I	Q	L	R	G	A	F	L	S	A	I	H	H	Q	I	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	Q	L	D	T	E	T	I	T	I	S	Y	E	F	I	L	C	Q	H	L	I	A	N	T	E	F	S	Y	L	A	L	P	E	N	Y	N	R	L	F	L	P	N	S	K	N	Q	T	N	N	R	F	K	T	L	N	S	K	A	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																		?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	L	L	A	A	G	G	V	Y	N	G	N	I	E	G	F	R	D	T	A	E	K	L	G	G	D	A	I	K	G	Y	D	Q	I	L	N	E	K	T	A	G	I	A	I	A	T	A	S	I	L	L	T	K	R	S	N	V	D	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?										?	?	?	?													?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	E	I	N	S	Y	L	G	K	L	R	G	Q	Q	K	L	L	D	G	I	D	I	I	E	I	I	Y	I	K	R	P	S	K	D	L	A	N	L	R	K	E	F	N	K	T	V	R	K	N	F	L	I	K	L	A	K	T	S	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?											?	?	?																									?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	G	R	F	N	A	E	D	L	L	R	M	R	K	G	N	V	P	L	N	Y	N	V	H	H	K	L	S	L	D	D	G	G	T	N	D	F	E	N	L	V	L	I	E	N	E	P	Y	H	K	V	F	T	N	M	Q	S	R	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?									?	?	?	?	?	?	?	?		?									?	?																						?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Sequence		K	G	I	L	V	G	E	S	K	I	T	P	W	A	I	P	S	G	S	I	Y	P	P	M	K	N	I	M	D	H	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?													?								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand