Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P25907 Date Thu Jan 5 11:42:46 GMT 2012 Unique Job ID f8b7c037cfce4f3a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	A	R	N	C	G	W	I	R	L	L	P	L	F	M	L	S	L	P	V	Q	A	E	L	R	C	V	A	N	A	V	D	I	E	S	F	F	S	A	A	T	A	E	D	K	Q	Q	V	E	Q	A	I	N	S	S	V	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	P	F	G	L	S	A	S	N	W	K	V	H	R	G	D	L	V	V	E	G	N	I	E	S	N	Q	K	L	I	V	L	G	N	L	T	V	K	G	N	I	S	T	F	S	L	S	N	P	W	V	I	L	G	N	V	T	A	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																						?										?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	V	A	D	S	P	L	L	I	T	G	S	I	N	A	S	G	L	V	F	I	D	S	Y	Y	D	N	P	S	T	I	K	G	S	I	N	A	R	G	I	F	I	N	D	I	I	A	P	V	V	A	S	S	T	N	S	E	F	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	A	S	D	K	H	D	T	E	N	V	K	K	A	L	M	I	I	N	P	D	A	Y	Y	W	G	L	I	N	D	E	D	A	L	K	E	I	F	K	R	S	N	I	R	M	A	G	N	V	C	N	Q	M	K	K	E	A	L	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?																																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	K	P	S	P	E	L	V	Q	E	L	Q	M	L	D	E	G	K	V	A	A	F	E	G	R	D	I	A	T	F	D	L	A	V	M	R	T	L	P	R	L	K	G	I	S	A	N	L	R	K	Q	L	I	N	S	N	D	E	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?					?		?																?					?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	E	S	M	A	R	Y	M	P	D	N	E	I	L	E	L	T	D	Q	Q	L	G	Y	Q	P	V	V	L	G	L	L	D	R	E	P	L	S	V	E	I	M	T	R	M	S	R	L	P	D	G	V	G	P	L	N	L	A	L	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	L	P	L	D	I	V	M	T	L	A	K	R	D	W	D	M	I	I	Q	E	L	Y	K	D	A	W	L	L	P	E	S	I	I	D	G	Y	I	R	S	D	D	S	S	I	R	Q	V	G	A	G	G	Q	L	T	Y	N	Q	A	M
Secondary structure
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Disorder																																																?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	L	A	N	D	S	S	N	N	V	V	T	S	L	A	F	K	L	A	E	M	K	H	H	G	Q	L	L	R	M	T	P	Q	E	S	D	K	V	A	G	Y	L	Y	Q	K	F	E	N	D	D	D	L	I	R	V	L	F	L	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	D	N	L	Q	F	N	F	V	K	R	M	E	K	K	S	P	A	Y	F	C	C	R	D	M	Q	V	I	H	S	D	A	A	L	Q	R	L	L	T	R	F	N	D	P	E	G	W	S	N	L	A	K	N	Q	Y	L	S	T	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	Q	K	I	W	Q	R	A	L	S	H	R	K	N	N	P	K	A	D	S	D	A	Y	E	T	S	A	D	M	I	L	S	E	L	I	S	H	G	E	V	D	D	Q	M	L	L	N	A	T	A	L	I	R	S	D	D	W	D	F	L
Secondary structure
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Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?											?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		E	S	A	L	I	S	W	D	N	L	P	A	V	V	L	K	E	L	Q	Q	N	T	P	R	N	D	I	W	A	K	F	F	L	R	Q	E	N	S	S	R	A	Q	V	D	E	A	L	R	V	Y	Y	A	L	D	P	D	A	L	A	Q
Secondary structure
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Sequence		L	D	V	L	A	K	Q	P	D	R	I	W	W	S	T	L	A	K	S	N	L	T	F	F	K	F	G	A	L	N	N	R	H	T	P	P	A	V	L	A	A	E	I	D	P	E	W	W	I	V	A	M	N	N	P	R	F	P	V	D
Secondary structure
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Disorder																																?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	L	K	A	R	L	K	R	D	P	L	L	A	L	E	L	V	N	P	E	L	D	L	V	R	Q	L	A	L	N	G	K	T	R	A	I	R	E	Q	A	M	R	K	L	D	E	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?													?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand