Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFF6 Date Thu Jan 5 11:26:07 GMT 2012 Unique Job ID f8574ffcb15887fa

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	E	I	L	A	V	V	E	A	V	S	N	E	K	A	L	P	R	E	K	I	F	E	A	L	E	S	A	L	A	T	A	T	K	K	K	Y	E	Q	E	I	D	V	R	V	Q	I	D	R	K	S	G	D	F	D	T	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	W	L	V	V	D	E	V	T	Q	P	T	K	E	I	T	L	E	A	A	R	Y	E	D	E	S	L	N	L	G	D	Y	V	E	D	Q	I	E	S	V	T	F	D	R	I	T	T	Q	T	A	K	Q	V	I	V	Q	K	V	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	E	R	A	M	V	V	D	Q	F	R	E	H	E	G	E	I	I	T	G	V	V	K	K	V	N	R	D	N	I	S	L	D	L	G	N	N	A	E	A	V	I	L	R	E	D	M	L	P	R	E	N	F	R	P	G	D	R	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	V	L	Y	S	V	R	P	E	A	R	G	A	Q	L	F	V	T	R	S	K	P	E	M	L	I	E	L	F	R	I	E	V	P	E	I	G	E	E	V	I	E	I	K	A	A	A	R	D	P	G	S	R	A	K	I	A	V	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	D	K	R	I	D	P	V	G	A	C	V	G	M	R	G	A	R	V	Q	A	V	S	T	E	L	G	G	E	R	I	D	I	V	L	W	D	D	N	P	A	Q	F	V	I	N	A	M	A	P	A	D	V	A	S	I	V	V	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	K	H	T	M	D	I	A	V	E	A	G	N	L	A	Q	A	I	G	R	N	G	Q	N	V	R	L	A	S	Q	L	S	G	W	E	L	N	V	M	T	V	D	D	L	Q	A	K	H	Q	A	E	A	H	A	A	I	D	T	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	Y	L	D	I	D	E	D	F	A	T	V	L	V	E	E	G	F	S	T	L	E	E	L	A	Y	V	P	M	K	E	L	L	E	I	E	G	L	D	E	P	T	V	E	A	L	R	E	R	A	K	N	A	L	A	T	I	A	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?																						?									?		?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	E	E	S	L	G	D	N	K	P	A	D	D	L	L	N	L	E	G	V	D	R	D	L	A	F	K	L	A	A	R	G	V	C	T	L	E	D	L	A	E	Q	G	I	D	D	L	A	D	I	E	G	L	T	D	E	K	A	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?																												?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Sequence		L	I	M	A	A	R	N	I	C	W	F	G	D	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand