Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76399 Date Thu Jan 5 12:22:40 GMT 2012 Unique Job ID f7f15792b2296720

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	K	F	F	A	L	F	I	Y	R	P	V	A	T	I	L	L	S	V	A	I	T	L	C	G	I	L	G	F	R	M	L	P	V	A	P	L	P	Q	V	D	F	P	V	I	I	V	S	A	S	L	P	G	A	S	P	E	T	M	A
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Disorder		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	S	V	A	T	P	L	E	R	S	L	G	R	I	A	G	V	S	E	M	T	S	S	S	S	L	G	S	T	R	I	I	L	Q	F	D	F	D	R	D	I	N	G	A	A	R	D	V	Q	A	A	I	N	A	A	Q	S	L	L	P
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Disorder															?	?	?	?	?							?	?	?																															?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	G	M	P	S	R	P	T	Y	R	K	A	N	P	S	D	A	P	I	M	I	L	T	L	T	S	D	T	Y	S	Q	G	E	L	Y	D	F	A	S	T	Q	L	A	P	T	I	S	Q	I	D	G	V	G	D	V	D	V	G	G	S
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Disorder		?	?	?	?	?		?					?		?	?		?										?			?																		?	?	?	?	?					?	?	?	?
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Sequence		S	L	P	A	V	R	V	G	L	N	P	Q	A	L	F	N	Q	G	V	S	L	D	D	V	R	T	A	V	S	N	A	N	V	R	K	P	Q	G	A	L	E	D	G	T	H	R	W	Q	I	Q	T	N	D	E	L	K	T	A	A	E
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	Q	P	L	I	I	H	Y	N	N	G	G	A	V	R	L	G	D	V	A	T	V	T	D	S	V	Q	D	V	R	N	A	G	M	T	N	A	K	P	A	I	L	L	M	I	R	K	L	P	E	A	N	I	I	Q	T	V	D	S	I
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Sequence		R	A	K	L	P	E	L	Q	E	T	I	P	A	A	I	D	L	Q	I	A	Q	D	R	S	P	T	I	R	A	S	L	E	E	V	E	Q	T	L	I	I	S	V	A	L	V	I	L	V	V	F	L	F	L	R	S	G	R	A	T	I
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	P	A	V	S	V	P	V	S	L	I	G	T	F	A	A	M	Y	L	C	G	F	S	L	N	N	L	S	L	M	A	L	T	I	A	T	G	F	V	V	D	D	A	I	V	V	L	E	N	I	A	R	H	L	E	A	G	M	K	P
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Sequence		L	Q	A	A	L	Q	G	T	R	E	V	G	F	T	V	L	S	M	S	L	S	L	V	A	V	F	L	P	L	L	L	M	G	G	L	P	G	R	L	L	R	E	F	A	V	T	L	S	V	A	I	G	I	S	L	L	V	S	L	T
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Sequence		L	T	P	M	M	C	G	W	M	L	K	A	S	K	P	R	E	Q	K	R	L	R	G	F	G	R	M	L	V	A	L	Q	Q	G	Y	G	K	S	L	K	W	V	L	N	H	T	R	L	V	G	V	V	L	L	G	T	I	A	L	N
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Sequence		I	W	L	Y	I	S	I	P	K	T	F	F	P	E	Q	D	T	G	V	L	M	G	G	I	Q	A	D	Q	S	I	S	F	Q	A	M	R	G	K	L	Q	D	F	M	K	I	I	R	D	D	P	A	V	D	N	V	T	G	F	T	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	S	R	V	N	S	G	M	M	F	I	T	L	K	P	R	D	E	R	S	E	T	A	Q	Q	I	I	D	R	L	R	V	K	L	A	K	E	P	G	A	N	L	F	L	M	A	V	Q	D	I	R	V	G	G	R	Q	S	N	A	S
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		Y	Q	Y	T	L	L	S	D	D	L	A	A	L	R	E	W	E	P	K	I	R	K	K	L	A	T	L	P	E	L	A	D	V	N	S	D	Q	Q	D	N	G	A	E	M	N	L	V	Y	D	R	D	T	M	A	R	L	G	I	D	V
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		Q	A	A	N	S	L	L	N	N	A	F	G	Q	R	Q	I	S	T	I	Y	Q	P	M	N	Q	Y	K	V	V	M	E	V	D	P	R	Y	T	Q	D	I	S	A	L	E	K	M	F	V	I	N	N	E	G	K	A	I	P	L	S	Y
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		F	A	K	W	Q	P	A	N	A	P	L	S	V	N	H	Q	G	L	S	A	A	S	T	I	S	F	N	L	P	T	G	K	S	L	S	D	A	S	A	A	I	D	R	A	M	T	Q	L	G	V	P	S	T	V	R	G	S	F	A	G
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		T	A	Q	V	F	Q	E	T	M	N	S	Q	V	I	L	I	I	A	A	I	A	T	V	Y	I	V	L	G	I	L	Y	E	S	Y	V	H	P	L	T	I	L	S	T	L	P	S	A	G	V	G	A	L	L	A	L	E	L	F	N	A
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		P	F	S	L	I	A	L	I	G	I	M	L	L	I	G	I	V	K	K	N	A	I	M	M	V	D	F	A	L	E	A	Q	R	H	G	N	L	T	P	Q	E	A	I	F	Q	A	C	L	L	R	F	R	P	I	M	M	T	T	L	A
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		A	L	F	G	A	L	P	L	V	L	S	G	G	D	G	S	E	L	R	Q	P	L	G	I	T	I	V	G	G	L	V	M	S	Q	L	L	T	L	Y	T	T	P	V	V	Y	L	F	F	D	R	L	R	L	R	F	S	R	K	P	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?																																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		Q	T	V	T	E
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Disorder		?	?	?	?	?
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