Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08956 Date Thu Jan 5 11:01:43 GMT 2012 Unique Job ID f79b410909736b67

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	M	N	K	S	N	F	E	F	L	K	G	V	N	D	F	T	Y	A	I	A	C	A	A	E	N	N	Y	P	D	D	P	N	T	T	L	I	K	M	R	M	F	G	E	A	T	A	K	H	L	G	L	L	L	N	I	P	P	C	E
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		N	Q	H	D	L	L	R	E	L	G	K	I	A	F	V	D	D	N	I	L	S	V	F	H	K	L	R	R	I	G	N	Q	A	V	H	E	Y	H	N	D	L	N	D	A	Q	M	C	L	R	L	G	F	R	L	A	V	W	Y	Y	R
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Disorder																																					?	?	?	?
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Sequence		L	V	T	K	D	Y	D	F	P	V	P	V	F	V	L	P	E	R	G	E	N	L	Y	H	Q	E	V	L	T	L	K	Q	Q	L	E	Q	Q	V	R	E	K	A	Q	T	Q	A	E	V	E	A	Q	Q	Q	K	L	V	A	L	N	G
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Disorder										?						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?														?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	I	A	I	L	E	G	K	Q	Q	E	T	E	A	Q	T	Q	A	R	L	A	A	L	E	A	Q	L	A	E	K	N	A	E	L	A	K	Q	T	E	Q	E	R	K	A	Y	H	K	E	I	T	D	Q	A	I	K	R	T	L	N	L
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?																?							?	?					?	?	?							?			?	?	?	?	?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	E	E	E	S	R	F	L	I	D	A	Q	L	R	K	A	G	W	Q	A	D	S	K	T	L	R	F	S	K	G	A	R	P	E	P	G	V	N	K	A	I	A	E	W	P	T	G	K	D	E	T	G	N	Q	G	F	A	D	Y	V
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Disorder																																																?	?	?	?	?	?
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Sequence		L	F	V	G	L	K	P	I	A	V	V	E	A	K	R	N	N	I	D	V	P	A	R	L	N	E	S	Y	R	Y	S	K	C	F	D	N	G	F	L	R	E	T	L	L	E	H	Y	S	P	D	E	V	H	E	A	V	P	E	Y	E
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Disorder																				?														?		?		?																						?	?
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Sequence		T	S	W	Q	D	T	S	G	K	Q	R	F	K	I	P	F	C	Y	S	T	N	G	R	E	Y	R	A	T	M	K	T	K	S	G	I	W	Y	R	D	V	R	D	T	R	N	M	S	K	A	L	P	E	W	H	R	P	E	E	L	L
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Disorder									?	?																						?	?	?									?	?		?
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Sequence		E	M	L	G	S	E	P	Q	K	Q	N	Q	W	F	A	D	N	P	G	M	S	E	L	G	L	R	Y	Y	Q	E	D	A	V	R	A	V	E	K	A	I	V	K	G	Q	Q	E	I	L	L	A	M	A	T	G	T	G	K	T	R	T
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Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	I	A	M	M	F	R	L	I	Q	S	Q	R	F	K	R	I	L	F	L	V	D	R	R	S	L	G	E	Q	A	L	G	A	F	E	D	T	R	I	N	G	D	T	F	N	S	I	F	D	I	K	G	L	T	D	K	F	P	E	D
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Disorder																																															?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		S	T	K	I	H	V	A	T	V	Q	S	L	V	K	R	T	L	Q	S	D	E	P	M	P	V	A	R	Y	D	C	I	V	V	D	E	A	H	R	G	Y	I	L	D	K	E	Q	T	E	G	E	L	Q	F	R	S	Q	L	D	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?		?		?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	A	Y	R	R	I	L	D	H	F	D	A	V	K	I	A	L	T	A	T	P	A	L	H	T	V	Q	I	F	G	E	P	V	Y	R	Y	T	Y	R	T	A	V	I	D	G	F	L	I	D	Q	D	P	P	I	Q	I	I	T	R	N
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		A	Q	E	G	V	Y	L	S	K	G	E	Q	V	E	R	I	S	P	Q	G	E	V	I	N	D	T	L	E	D	D	Q	D	F	E	V	A	D	F	N	R	G	L	V	I	P	A	F	N	R	A	V	C	N	E	L	T	N	Y	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?				?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		P	T	G	S	Q	K	T	L	V	F	C	V	T	N	A	H	A	D	M	V	V	E	E	L	R	A	A	F	K	K	K	Y	P	Q	L	E	H	D	A	I	I	K	I	T	G	D	A	D	K	D	A	R	K	V	Q	T	M	I	T	R
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Disorder																																															?	?	?	?	?										?
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Sequence		F	N	K	E	R	L	P	N	I	V	V	T	V	D	L	L	T	T	G	V	D	I	P	S	I	C	N	I	V	F	L	R	K	V	R	S	R	I	L	Y	E	Q	M	K	G	R	A	T	R	L	C	P	E	V	N	K	T	S	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
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Sequence		I	F	D	C	V	D	I	Y	S	T	L	E	S	V	D	T	M	R	P	V	V	V	R	P	K	V	E	L	Q	T	L	V	N	E	I	T	D	S	E	T	Y	K	I	T	E	A	D	G	R	S	F	A	E	H	S	H	E	Q	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?		?	?	?	?	?												?
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Sequence		A	K	L	Q	R	I	I	G	L	A	T	F	N	R	D	R	S	E	T	I	D	K	Q	V	R	R	L	D	E	L	C	Q	D	A	A	G	V	N	F	N	G	F	A	S	R	L	R	E	K	G	P	H	W	S	A	E	V	F	N	K
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SS confidence
Disorder														?	?
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Sequence		L	P	G	F	I	A	R	L	E	K	L	K	T	D	I	N	N	L	N	D	A	P	I	F	L	D	I	D	D	E	V	V	S	V	K	S	L	Y	G	D	Y	D	T	P	Q	D	F	L	E	A	F	D	S	L	V	Q	R	S	P	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?																	?	?	?	?		?																	?
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Disorder															?															?	?	?
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Sequence		A	V	G	D	A	L	K	P	F	E	E	R	V	D	H	A	L	T	R	I	K	G	E	N	D	W	S	S	E	Q	L	S	W	L	D	R	L	A	Q	A	L	K	E	K	V	V	L	D	D	D	V	F	K	T	G	N	F	H	R	R
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Disorder																							?	?	?	?																		?					?				?		?				?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170
Sequence		G	G	K	A	M	L	Q	R	T	F	D	D	N	L	D	T	L	L	G	K	F	S	D	Y	I	W	D	E	L	A
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SS confidence
Disorder		?								?																			?	?	?
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