Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52005 Date Thu Jan 5 12:04:53 GMT 2012 Unique Job ID f6cb57de6d012571

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	G	K	K	R	I	G	L	L	F	L	L	I	A	V	V	V	G	G	G	G	L	L	L	A	Q	K	V	L	H	K	T	S	D	T	A	F	C	L	S	C	H	S	M	S	K	P	F	E	E	Y	Q	G	T	V	H	F	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																																			?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	K	G	I	R	A	E	C	A	D	C	H	I	P	K	S	G	M	D	Y	L	F	A	K	L	K	A	S	K	D	I	Y	H	E	F	V	S	G	K	I	D	S	D	D	K	F	E	A	H	R	Q	E	M	A	E	T	V	W	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?																																																	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	K	A	T	D	S	A	T	C	R	S	C	H	S	F	D	A	M	D	I	A	S	Q	S	E	S	A	Q	K	M	H	N	K	A	Q	K	D	S	E	T	C	I	D	C	H	K	G	I	A	H	F	P	P	E	I	K	M	D	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?											?	?		?	?	?	?	?	?					?	?					?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	A	H	E	L	E	S	Q	A	A	T	S	V	T	N	G	A	H	I	Y	P	F	K	T	S	H	I	G	E	L	A	T	V	N	P	G	T	D	L	T	V	V	D	A	S	G	K	Q	P	I	V	L	L	Q	G	Y	Q	M	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?												?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	E	N	T	L	Y	L	A	A	G	Q	R	L	A	L	A	T	L	S	E	E	G	I	K	A	L	T	V	N	G	E	W	Q	A	D	E	Y	G	N	Q	W	R	Q	A	S	L	Q	G	A	L	T	D	P	A	L	A	D	R	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	W	Q	Y	A	E	K	L	D	D	T	Y	C	A	G	C	H	A	P	I	A	A	D	H	Y	T	V	N	A	W	P	S	I	A	K	G	M	G	A	R	T	S	M	S	E	N	E	L	D	I	L	T	R	Y	F	Q	Y	N	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?												?	?		?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		D	I	T	E	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand