Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15069 Date Thu Jan 5 11:34:32 GMT 2012 Unique Job ID f64c5a298b28782e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	P	R	I	K	P	L	L	V	L	C	A	A	L	L	T	V	T	P	A	A	S	A	D	V	N	S	D	M	N	Q	F	F	N	K	L	G	F	A	S	N	T	T	Q	P	G	V	W	Q	G	Q	A	A	G	Y	A	Y	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?												?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	L	Y	A	R	T	Q	V	K	N	V	Q	L	I	S	M	T	L	P	D	I	N	A	G	C	G	G	I	D	A	Y	L	G	S	F	S	F	I	N	G	E	Q	L	Q	R	F	V	K	Q	I	M	S	N	A	A	G	Y	F	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	L	Q	T	T	V	P	E	I	K	T	A	K	D	F	L	Q	K	M	A	S	D	I	N	S	M	N	L	S	S	C	Q	A	A	Q	G	I	I	G	G	L	F	P	R	T	Q	V	S	Q	Q	K	V	C	Q	D	I	A	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	N	I	F	A	D	W	A	A	S	R	Q	G	C	T	V	G	G	K	S	D	S	V	R	D	K	A	S	D	K	D	K	E	R	V	T	K	N	I	N	I	M	W	N	A	L	S	K	N	R	M	F	D	G	N	K	E	L	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?										?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	V	M	T	L	T	G	S	L	V	F	G	P	N	G	E	I	T	P	L	S	A	R	T	T	D	R	S	I	I	R	A	M	M	E	G	G	T	A	K	I	S	H	C	N	D	S	D	K	C	L	K	V	V	A	D	T	P	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?		?					?		?																													?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	S	R	D	N	A	L	K	S	Q	I	T	K	L	L	A	S	I	Q	N	K	A	V	S	D	T	P	L	D	D	K	E	K	G	F	I	S	S	T	T	I	P	V	F	K	Y	L	V	D	P	Q	M	L	G	V	S	N	S	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																			?		?			?										?			?	?	?											?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	Q	L	T	D	Y	I	G	Y	D	I	L	L	Q	Y	I	Q	E	L	I	Q	Q	A	R	A	M	V	A	T	G	N	Y	D	E	A	V	I	G	H	I	N	D	N	M	N	D	A	T	R	Q	I	A	A	F	Q	S	Q	V	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	Q	D	A	L	L	V	V	D	R	Q	M	S	Y	M	R	Q	Q	L	S	A	R	M	L	S	R	Y	Q	N	N	Y	H	F	G	G	S	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand