Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABC7 Date Thu Jan 5 11:15:10 GMT 2012 Unique Job ID f60184711b331ed6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	W	N	Q	P	G	N	N	G	Q	D	R	D	P	W	G	S	S	K	P	G	G	N	S	E	G	N	G	N	K	G	G	R	D	Q	G	P	P	D	L	D	D	I	F	R	K	L	S	K	K	L	G	G	L	G	G	G	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	G	S	G	G	G	S	S	S	Q	G	P	R	P	Q	L	G	G	R	V	V	T	I	A	A	A	A	I	V	I	I	W	A	A	S	G	F	Y	T	I	K	E	A	E	R	G	V	V	T	R	F	G	K	F	S	H	L	V	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	N	W	K	P	T	F	I	D	E	V	K	P	V	N	V	E	A	V	R	E	L	A	A	S	G	V	M	L	T	S	D	E	N	V	V	R	V	E	M	N	V	Q	Y	R	V	T	N	P	E	K	Y	L	Y	S	V	T	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	D	S	L	R	Q	A	T	D	S	A	L	R	G	V	I	G	K	Y	T	M	D	R	I	L	T	E	G	R	T	V	I	R	S	D	T	Q	R	E	L	E	E	T	I	R	P	Y	D	M	G	I	T	L	L	D	V	N	F	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	R	P	P	E	E	V	K	A	A	F	D	D	A	I	A	A	R	E	N	E	Q	Q	Y	I	R	E	A	E	A	Y	T	N	E	V	Q	P	R	A	N	G	Q	A	Q	R	I	L	E	E	A	R	A	Y	K	A	Q	T	I	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	Q	G	E	V	A	R	F	A	K	L	L	P	E	Y	K	A	A	P	E	I	T	R	E	R	L	Y	I	E	T	M	E	K	V	L	G	N	T	R	K	V	L	V	N	D	K	G	G	N	L	M	V	L	P	L	D	Q	M	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																						?								?								?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	G	N	A	P	A	A	K	S	D	N	G	A	S	N	L	L	R	L	P	P	A	S	S	S	T	T	S	G	A	S	N	T	S	S	T	S	Q	G	D	I	M	D	Q	R	R	A	N	A	Q	R	N	D	Y	Q	R	Q	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand