Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16919 Date Wed Jan 25 15:20:40 GMT 2012 Unique Job ID f54722af1d87bd4f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	K	P	A	A	R	Q	G	D	M	T	Q	Y	G	G	P	I	V	Q	G	S	A	G	V	R	I	G	A	P	T	G	V	A	C	S	V	C	P	G	G	M	T	S	G	N	P	V	N	P	L	L	G	A	K	V	L	P	G
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?				?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	T	D	L	A	L	P	G	P	L	P	F	I	L	S	R	T	Y	S	S	Y	R	T	K	T	P	A	P	V	G	V	F	G	P	G	W	K	A	P	S	D	I	R	L	Q	L	R	D	D	G	L	I	L	N	D	N	G	G	R	S
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Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	H	F	E	P	L	L	P	G	E	A	V	Y	S	R	S	E	S	M	W	L	V	R	G	G	K	A	A	Q	P	D	G	H	T	L	A	R	L	W	G	A	L	P	P	D	I	R	L	S	P	H	L	Y	L	A	T	N	S	A	Q
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Disorder																			?																									?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	P	W	W	I	L	G	W	S	E	R	V	P	G	A	E	D	V	L	P	A	P	L	P	P	Y	R	V	L	T	G	M	A	D	R	F	G	R	T	L	T	Y	R	R	E	A	A	G	D	L	A	G	E	I	T	G	V	T	D	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	G	R	E	F	R	L	V	L	T	T	Q	A	Q	R	A	E	E	A	R	T	S	S	L	S	S	S	D	S	S	R	P	L	S	A	S	A	F	P	D	T	L	P	G	T	E	Y	G	P	D	R	G	I	R	L	S	A	V	W	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	H	D	P	A	Y	P	E	S	L	P	A	A	P	L	V	R	Y	T	Y	T	E	A	G	E	L	L	A	V	Y	D	R	S	N	T	Q	V	R	A	F	T	Y	D	A	Q	H	P	G	R	M	V	A	H	R	Y	A	G	R	P	E
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	R	Y	R	Y	D	D	T	G	R	V	V	E	Q	L	N	P	A	G	L	S	Y	R	Y	L	Y	E	Q	D	R	I	T	V	T	D	S	L	N	R	R	E	V	L	H	T	E	G	G	A	G	L	K	R	V	V	K	K	E	L	A
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Sequence		D	G	S	V	T	R	S	G	Y	D	A	A	G	R	L	T	A	Q	T	D	A	A	G	R	R	T	E	Y	G	L	N	V	V	S	G	D	I	T	D	I	T	T	P	D	G	R	E	T	K	F	Y	Y	N	D	G	N	Q	L	T	A
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Sequence		V	V	S	P	D	G	L	E	S	R	R	E	Y	D	E	P	G	R	L	V	S	E	T	S	R	S	G	E	T	V	R	Y	R	Y	D	D	A	H	S	E	L	P	A	T	T	T	D	A	T	G	S	T	R	Q	M	T	W	S	R	Y
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	Q	L	L	A	F	T	D	C	S	G	Y	Q	T	R	Y	E	Y	D	R	F	G	Q	M	T	A	V	H	R	E	E	G	I	S	L	Y	R	R	Y	D	N	R	G	R	L	T	S	V	K	D	A	Q	G	R	E	T	R	Y	E	Y
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	A	A	G	D	L	T	A	V	I	T	P	D	G	N	R	S	E	T	Q	Y	D	A	W	G	K	A	V	S	T	T	Q	G	G	L	T	R	S	M	E	Y	D	A	A	G	R	V	I	S	L	T	N	E	N	G	S	H	S	V	F
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	Y	D	A	L	D	R	L	V	Q	Q	G	G	F	D	G	R	T	Q	R	Y	H	Y	D	L	T	G	K	L	T	Q	S	E	D	E	G	L	V	I	L	W	Y	Y	D	E	S	D	R	I	T	H	R	T	V	N	G	E	P	A	E
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		Q	W	Q	Y	D	G	H	G	W	L	T	D	I	S	H	L	S	E	G	H	R	V	A	V	H	Y	G	Y	D	D	K	G	R	L	T	G	E	C	Q	T	V	E	N	P	E	T	G	E	L	L	W	Q	H	E	T	K	H	A	Y	N
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Disorder																	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		E	Q	G	L	A	N	R	V	T	P	D	S	L	P	P	V	E	W	L	T	Y	G	S	G	Y	L	A	G	M	K	L	G	G	T	P	L	V	E	Y	T	R	D	R	L	H	R	E	T	V	R	S	F	G	S	M	A	G	S	N	A
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Disorder																																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		A	Y	E	L	T	S	T	Y	T	P	A	G	Q	L	Q	S	Q	H	L	N	S	L	V	Y	D	R	D	Y	G	W	S	D	N	G	D	L	V	R	I	S	G	P	R	Q	T	R	E	Y	G	Y	S	A	T	G	R	L	E	S	V	R
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	L	A	P	D	L	D	I	R	I	P	Y	A	T	D	P	A	G	N	R	L	P	D	P	E	L	H	P	D	S	T	L	T	V	W	P	D	N	R	I	A	E	D	A	H	Y	V	Y	R	H	D	E	Y	G	R	L	T	E	K	T
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Disorder			?																						?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		D	R	I	P	A	G	V	I	R	T	D	D	E	R	T	H	H	Y	H	Y	D	S	Q	H	R	L	V	F	Y	T	R	I	Q	H	G	E	P	L	V	E	S	R	Y	L	Y	D	P	L	G	R	R	M	A	K	R	V	W	R	R	E
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Disorder			?	?		?
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Sequence		R	D	L	T	G	W	M	S	L	S	R	K	P	E	V	T	W	Y	G	W	D	G	D	R	L	T	T	V	Q	T	D	T	T	R	I	Q	T	V	Y	E	P	G	S	F	T	P	L	I	R	V	E	T	E	N	G	E	R	E	K	A
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		Q	R	R	S	L	A	E	T	L	Q	Q	E	G	S	E	N	G	H	G	V	V	F	P	A	E	L	V	R	L	L	D	R	L	E	E	E	I	R	A	D	R	V	S	S	E	S	R	A	W	L	A	Q	C	G	L	T	V	E	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		A	R	Q	V	E	P	E	Y	T	P	A	R	K	A	H	L	Y	H	C	D	H	R	G	L	P	L	A	L	I	S	E	D	G	N	T	A	W	S	A	E	Y	D	E	W	G	N	Q	L	N	E	E	N	P	H	H	V	Y	Q	P	Y
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Disorder					?	?																																													?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		T	W	D	D	A	R	S	G	A	C	T	G	G	V	C	G	V	L	S	R	I	I	G	P	S	K	F	D	S	T	A	D	A	A	L	D	A	L	K	E	T	Q	N	R	S	L	C	N	D	M	E	Y	S	G	I	V	C	K	D	T
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Sequence		N	G	K	Y	F	A	S	K	A	E	T	D	N	L	R	K	E	S	Y	P	L	K	R	K	C	P	T	G	T	D	R	V	A	A	Y	H	T	H	G	A	D	S	H	G	D	Y	V	D	E	F	F	S	S	S	D	K	N	L	V	R
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Disorder		?	?	?	?	?	?				?	?	?	?		?	?	?																							?	?		?												?					?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	K	D	N	N	L	E	A	F	Y	L	A	T	P	D	G	R	F	E	A	L	N	N	K	G	E	Y	I	F	I	R	N	S	V	P	G	L	S	S	V	C	I	P	Y	H	D
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Disorder		?																																								?	?	?	?	?	?
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