Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39336 Date Thu Jan 5 11:59:27 GMT 2012 Unique Job ID f4d7d81ed7f3e669

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	K	I	S	D	L	N	Y	S	Q	H	I	T	L	A	D	N	F	K	Q	K	S	E	V	L	N	T	W	R	V	G	M	N	D	F	A	R	I	A	G	G	Q	D	N	R	R	N	I	L	S	P	G	A	F	L	E	F	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	I	F	T	L	G	Y	V	D	F	S	K	R	S	N	E	A	G	R	N	M	M	A	H	I	K	S	S	S	Y	S	K	D	T	N	G	N	E	K	M	K	F	Y	M	N	N	P	V	G	E	R	A	D	S	P	K	V	I	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?									?	?		?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	S	L	S	T	I	T	T	M	G	T	R	Q	G	H	T	A	I	I	F	P	Q	P	D	G	S	T	N	R	Y	E	G	K	S	F	E	R	K	D	E	S	S	L	H	L	I	T	N	K	V	L	A	C	Y	Q	S	E	A	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	I	A	R	L	L	N	N	N	Q	E	L	N	N	L	Q	K	L	N	N	L	Q	K	L	N	N	L	L	K	L	N	N	I	Q	G	L	N	N	P	Q	E	L	N	N	P	Q	N	L	N	D	S	Q	E	L	N	N	S	Q	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	S	P	Q	E	L	N	D	P	Q	E	L	N	N	S	Q	D	L	N	N	S	K	V	S	C	T	V	S	V	D	S	T	I	T	G	L	L	K	E	P	L	N	N	A	L	L	A	I	R	N	E	H	L	L	L	M	P	H	V	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?		?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	E	S	I	S	Y	L	L	G	E	K	G	I	L	E	E	I	D	K	L	Y	A	L	N	D	H	G	I	D	N	D	K	V	G	N	N	E	I	N	D	I	K	V	N	L	S	H	I	L	I	D	S	L	D	D	A	K	V	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?						?		?							?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	P	V	I	D	S	I	L	E	T	F	S	K	S	P	Y	I	N	D	V	R	I	L	D	W	C	F	N	K	S	M	Q	Y	F	D	D	T	K	K	I	K	H	A	C	S	V	I	N	H	I	N	L	R	S	D	Q	S	K	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?																				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	T	L	F	F	N	L	D	K	E	P	Y	K	N	S	P	E	L	Q	G	L	I	W	N	K	L	V	V	Y	V	N	E	F	N	L	S	N	R	E	K	T	N	L	I	Q	R	L	F	D	N	V	E	S	I	F	N	E	V	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	I	L	V	N	D	I	F	M	N	D	F	F	M	K	N	P	E	M	I	N	W	Y	F	P	Q	L	L	K	S	Y	E	G	E	K	I	Y	F	D	N	L	K	Y	D	L	N	D	N	D	K	E	S	N	K	E	I	L	K	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	D	N	V	I	K	E	K	L	N	N	E	Y	K	L	R	F	R	M	M	Q	T	I	L	Q	S	R	V	N	V	L	P	Y	I	N	E	Q	R	L	N	K	L	N	P	P	E	N	L	R	I	A	I	E	H	F	G	W	K	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																			?	?	?		?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.
Sequence		P	I	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand