Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFU2 Date Thu Jan 5 11:27:16 GMT 2012 Unique Job ID f4ae09e4e60b31d6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	G	E	L	I	W	V	L	S	L	L	A	V	A	I	V	L	F	A	T	G	R	V	R	M	D	A	V	A	L	F	V	I	V	A	F	A	L	S	G	T	L	T	V	P	E	V	F	S	G	F	S	D	P	N	V	V	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	A	L	F	I	I	G	D	G	L	V	R	T	G	V	A	T	V	M	G	T	W	L	V	K	V	A	G	N	S	E	I	K	M	L	V	L	L	M	L	T	V	A	G	L	G	A	F	M	S	S	T	G	V	V	A	I	F	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	V	L	S	V	A	M	R	M	Q	T	S	P	S	R	L	M	M	P	L	S	F	A	G	L	I	S	G	M	M	T	L	V	A	T	P	P	N	L	V	V	N	S	E	L	L	R	E	G	Y	H	G	F	S	F	F	S	V	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	G	L	V	V	L	V	L	G	I	L	Y	M	L	V	M	R	F	M	L	K	G	D	T	Q	T	P	Q	R	E	G	W	T	R	R	T	F	R	D	L	I	R	E	Y	R	L	T	G	R	A	R	R	L	A	I	R	P	G	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	I	G	Q	R	L	D	D	L	K	L	R	E	R	Y	G	A	N	V	I	G	V	E	R	W	R	R	F	R	R	V	I	V	N	V	N	G	V	S	E	F	R	A	R	D	V	L	L	I	D	M	S	A	A	D	V	D	L	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?											?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	C	S	E	Q	L	L	E	P	M	V	L	R	G	E	Y	F	S	D	Q	A	L	D	V	G	M	A	E	I	S	L	I	P	E	S	E	L	I	G	K	S	V	R	E	I	G	F	R	T	R	Y	G	L	N	V	V	G	L	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	G	V	A	L	E	G	S	L	A	D	E	P	L	L	L	G	D	I	I	L	V	V	G	N	W	K	L	I	G	M	L	A	K	Q	G	R	D	F	V	A	L	N	L	P	E	E	V	S	E	A	S	P	A	H	S	Q	A	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	I	F	C	L	V	L	M	V	A	L	M	L	T	D	E	I	P	N	P	V	A	A	I	I	A	C	L	L	M	G	K	F	R	C	I	D	A	E	S	A	Y	K	S	I	H	W	P	S	I	I	L	I	V	G	M	M	P	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	A	L	Q	K	T	G	G	V	A	L	A	V	K	G	L	M	D	I	G	G	G	Y	G	P	H	M	M	L	G	C	L	F	V	L	S	A	V	I	G	L	F	I	S	N	T	A	T	A	V	L	M	A	P	I	A	L	A	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	T	M	G	V	S	P	Y	P	F	A	M	V	V	A	M	A	A	S	A	A	F	M	T	P	V	S	S	P	V	N	T	L	V	L	G	P	G	N	Y	S	F	S	D	F	V	K	L	G	V	P	F	T	I	I	V	M	A	V	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Sequence		V	V	M	I	P	M	L	F	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand