Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33363 Date Thu Jan 5 11:52:06 GMT 2012 Unique Job ID f44e8a91bf2644fb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	W	L	C	S	V	G	I	A	V	S	L	A	L	Q	P	A	L	A	D	D	L	F	G	N	H	P	L	T	P	E	A	R	D	A	F	V	T	E	L	L	K	K	M	T	V	D	E	K	I	G	Q	L	R	L	I	S	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	D	N	P	K	E	A	I	R	E	M	I	K	D	G	Q	V	G	A	I	F	N	T	V	T	R	Q	D	I	R	A	M	Q	D	Q	V	M	E	L	S	R	L	K	I	P	L	F	F	A	Y	D	V	L	H	G	Q	R	T	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	I	S	L	G	L	A	S	S	F	N	L	D	A	V	K	T	V	G	R	V	S	A	Y	E	A	A	D	D	G	L	N	M	T	W	A	P	M	V	D	V	S	R	D	P	R	W	G	R	A	S	E	G	F	G	E	D	T	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	S	T	M	G	K	T	M	V	E	A	M	Q	G	K	S	P	A	D	R	Y	S	V	M	T	S	V	K	H	F	A	A	Y	G	A	V	E	G	G	K	E	Y	N	T	V	D	M	S	P	Q	R	L	F	N	D	Y	M	P	P	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	A	G	L	D	A	G	S	G	A	V	M	V	A	L	N	S	L	N	G	T	P	A	T	S	D	S	W	L	L	K	D	V	L	R	D	Q	W	G	F	K	G	I	T	V	S	D	H	G	A	I	K	E	L	I	K	H	G	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	D	P	E	D	A	V	R	V	A	L	K	S	G	I	N	M	S	M	S	D	E	Y	Y	S	K	Y	L	P	G	L	I	K	S	G	K	V	T	M	A	E	L	D	D	A	A	R	H	V	L	N	V	K	Y	D	M	G	L	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	P	Y	S	H	L	G	P	K	E	S	D	P	V	D	T	N	A	E	S	R	L	H	R	K	E	A	R	E	V	A	R	E	S	L	V	L	L	K	N	R	L	E	T	L	P	L	K	K	S	A	T	I	A	V	V	G	P	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	S	K	R	D	V	M	G	S	W	S	A	A	G	V	A	D	Q	S	V	T	V	L	T	G	I	K	N	A	V	G	E	N	G	K	V	L	Y	A	K	G	A	N	V	T	S	D	K	G	I	I	D	F	L	N	Q	Y	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	K	V	D	P	R	S	P	Q	E	M	I	D	E	A	V	Q	T	A	K	Q	S	D	V	V	V	A	V	V	G	E	A	Q	G	M	A	H	E	A	S	S	R	T	D	I	T	I	P	Q	S	Q	R	D	L	I	A	A	L	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	G	K	P	L	V	L	V	L	M	N	G	R	P	L	A	L	V	K	E	D	Q	Q	A	D	A	I	L	E	T	W	F	A	G	T	E	G	G	N	A	I	A	D	V	L	F	G	D	Y	N	P	S	G	K	L	P	M	S	F	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	S	V	G	Q	I	P	V	Y	Y	S	H	L	N	T	G	R	P	Y	N	A	D	K	P	N	K	Y	T	S	R	Y	F	D	E	A	N	G	A	L	Y	P	F	G	Y	G	L	S	Y	T	T	F	T	V	S	D	V	K	L	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?																																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		P	T	M	K	R	D	G	K	V	T	A	S	V	Q	V	T	N	T	G	K	R	E	G	A	T	V	V	Q	M	Y	L	Q	D	V	T	A	S	M	S	R	P	V	K	Q	L	K	G	F	E	K	I	T	L	K	P	G	E	T	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.
Sequence		V	S	F	P	I	D	I	E	A	L	K	F	W	N	Q	Q	M	K	Y	D	A	E	P	G	K	F	N	V	F	I	G	T	D	S	A	R	V	K	K	G	E	F	E	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?						?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand