Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52600 Date Thu Jan 5 12:05:50 GMT 2012 Unique Job ID f3d66b128fa44656

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	I	T	K	S	T	P	A	P	L	T	G	G	T	L	W	C	V	T	I	A	L	S	L	A	T	F	M	Q	M	L	D	S	T	I	S	N	V	A	I	P	T	I	S	G	F	L	G	A	S	T	D	E	G	T	W	V	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	F	G	V	A	N	A	I	A	I	P	V	T	G	R	L	A	Q	R	I	G	E	L	R	L	F	L	L	S	V	T	F	F	S	L	S	S	L	M	C	S	L	S	T	N	L	D	V	L	I	F	F	R	V	V	Q	G	L	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	P	L	I	P	L	S	Q	S	L	L	L	R	N	Y	P	P	E	K	R	T	F	A	L	A	L	W	S	M	T	V	I	I	A	P	I	C	G	P	I	L	G	G	Y	I	C	D	N	F	S	W	G	W	I	F	L	I	N	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	G	I	I	V	L	T	L	C	L	T	L	L	K	G	R	E	T	E	T	S	P	V	K	M	N	L	P	G	L	T	L	L	V	L	G	V	G	G	L	Q	I	M	L	D	K	G	R	D	L	D	W	F	N	S	S	T	I	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	T	V	V	S	V	I	S	L	I	S	L	V	I	W	E	S	T	S	E	N	P	I	L	D	L	S	L	F	K	S	R	N	F	T	I	G	I	V	S	I	T	C	A	Y	L	F	Y	S	G	A	I	V	L	M	P	Q	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	T	M	G	Y	N	A	I	W	A	G	L	A	Y	A	P	I	G	I	M	P	L	L	I	S	P	L	I	G	R	Y	G	N	K	I	D	M	R	L	L	V	T	F	S	F	L	M	Y	A	V	C	Y	Y	W	R	S	V	T	F	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	T	I	D	F	T	G	I	I	L	P	Q	F	F	Q	G	F	A	V	A	C	F	F	L	P	L	T	T	I	S	F	S	G	L	P	D	N	K	F	A	N	A	S	S	M	S	N	F	F	R	T	L	S	G	S	V	G	T	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	M	T	L	W	G	R	R	E	S	L	H	H	S	Q	L	T	A	T	I	D	Q	F	N	P	V	F	N	S	S	S	Q	I	M	D	K	Y	Y	G	S	L	S	G	V	L	N	E	I	N	N	E	I	T	Q	Q	S	L	S	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Sequence		A	N	E	I	F	R	M	A	A	I	A	F	I	L	L	T	V	L	V	W	F	A	K	P	P	F	T	A	K	G	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand