Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77779 Date Thu Jan 5 12:32:45 GMT 2012 Unique Job ID f3c6b0c7d5189d78

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	W	P	D	N	R	I	A	R	D	A	H	Y	L	Y	R	Y	D	R	H	G	R	L	T	E	K	T	D	L	I	P	E	G	V	I	R	T	D	D	E	R	T	H	R	Y	H	Y	D	S	Q	H	R	L	V	H	Y	T	R	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	A	E	P	L	V	E	S	R	Y	L	Y	D	P	L	G	R	R	V	A	K	R	V	W	R	R	E	R	D	L	T	G	W	M	S	L	S	R	K	P	Q	V	T	W	Y	G	W	D	G	D	R	L	T	T	I	Q	N	D	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	I	Q	T	I	Y	Q	P	G	S	F	T	P	L	I	R	V	E	T	A	T	G	E	L	A	K	T	Q	R	R	S	L	A	D	T	L	Q	Q	S	G	G	E	D	G	G	S	V	V	F	P	P	V	L	V	Q	M	L	D	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	S	E	I	L	A	D	R	V	S	E	E	S	R	R	W	L	A	S	C	G	L	T	V	E	Q	M	Q	N	Q	M	D	P	V	Y	T	P	A	R	K	I	H	L	Y	H	C	D	H	R	G	L	P	L	A	L	V	S	T	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	T	E	W	C	A	E	Y	D	E	W	G	N	L	L	N	E	E	N	P	H	Q	L	Q	Q	L	I	R	L	P	G	Q	Q	Y	D	E	E	S	G	L	Y	Y	N	R	H	R	Y	Y	D	P	L	Q	G	R	Y	I	T	Q	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	G	L	K	G	G	W	N	F	Y	Q	Y	P	L	N	P	V	Q	Y	I	D	S	M	G	L	A	S	K	Y	G	H	L	N	N	G	G	Y	G	A	R	P	N	K	P	P	T	P	D	P	S	K	L	P	D	I	A	K	Q	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?			?						?	?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	P	Y	P	I	D	Q	A	S	S	A	P	N	V	F	K	T	F	F	R	A	L	S	P	Y	D	Y	T	L	Y	C	R	K	W	V	K	P	N	L	T	C	T	P	Q	D	D	S	Q	Y	P	G	M	D	T	K	T	A	S	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?		?	?		?	?																								?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	P	Q	T	N	W	P	T	T	Q	L	P	P	G	Y	T	C	A	E	P	Y	L	F	P	D	I	N	K	P	D	G	P	A	T	A	G	I	D	D	L	G	E	I	L	A	K	M	K	Q	R	T	S	R	G	I	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand