Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0CB39 Date Thu Jan 5 11:30:09 GMT 2012 Unique Job ID f351643b35169a23

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	S	T	E	V	Q	A	K	P	L	F	S	W	K	A	L	G	W	A	L	L	Y	F	W	F	F	S	T	L	L	Q	A	I	I	Y	I	S	G	Y	S	G	T	N	G	I	R	D	S	L	L	F	S	S	L	W	L	I	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	L	F	P	K	R	I	K	I	I	A	A	V	I	G	V	V	L	W	A	A	S	L	A	A	L	C	Y	Y	V	I	Y	G	Q	E	F	S	Q	S	V	L	F	V	M	F	E	T	N	T	N	E	A	S	E	Y	L	S	Q	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	K	I	V	L	I	A	L	A	Y	T	A	V	A	V	L	L	W	T	R	L	R	P	V	Y	I	P	K	P	W	R	Y	V	V	S	F	A	L	L	Y	G	L	I	L	H	P	I	A	M	N	T	F	I	K	N	K	P	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	T	L	D	N	L	A	S	R	M	E	P	A	A	P	W	Q	F	L	T	G	Y	Y	Q	Y	R	Q	Q	L	N	S	L	T	K	L	L	N	E	N	N	A	L	P	P	L	A	N	F	K	D	E	S	G	N	E	P	R	T	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?								?		?																	?	?				?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	V	I	G	E	S	T	Q	R	G	R	M	S	L	Y	G	Y	P	R	E	T	T	P	E	L	D	A	L	H	K	T	D	P	N	L	T	V	F	N	N	V	V	T	S	R	P	Y	T	I	E	I	L	Q	Q	A	L	T	F	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	K	N	P	D	L	Y	L	T	Q	P	S	L	M	N	M	M	K	Q	A	G	Y	K	T	F	W	I	T	N	Q	Q	T	M	T	A	R	N	T	M	L	T	V	F	S	R	Q	T	D	K	Q	Y	Y	M	N	Q	Q	R	T	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																														?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	R	E	Y	D	T	N	V	L	K	P	F	Q	E	V	L	N	D	P	A	P	K	K	L	I	I	V	H	L	L	G	T	H	I	K	Y	K	Y	R	Y	P	E	N	Q	G	K	F	D	G	N	T	D	H	V	P	P	G	L	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																																				?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	E	L	E	S	Y	N	D	Y	D	N	A	N	L	Y	N	D	H	V	V	A	S	L	I	K	D	F	K	A	A	N	P	N	G	F	L	V	Y	F	S	D	H	G	E	E	V	Y	D	T	P	P	H	K	T	Q	G	R	N	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																													?		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	P	T	R	H	M	Y	T	I	P	F	L	L	W	T	S	E	K	W	Q	A	T	H	P	R	D	F	S	Q	D	V	D	R	K	Y	S	L	A	E	L	I	H	T	W	S	D	L	A	G	L	S	Y	D	G	Y	D	P	T	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?														?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	V	N	P	Q	F	K	E	T	T	R	W	I	G	N	P	Y	K	K	N	A	L	I	D	Y	D	T	L	P	Y	G	D	Q	V	G	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand