Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A930 Date Thu Jan 5 11:09:15 GMT 2012 Unique Job ID f31239463cc52480

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	K	S	K	M	K	L	M	P	L	L	V	S	V	T	L	I	S	G	C	T	V	L	P	G	S	N	M	S	T	M	G	K	D	V	I	K	Q	Q	D	A	D	F	D	L	D	K	M	V	N	V	Y	P	L	T	P	R	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Q	L	R	P	R	P	N	V	A	R	P	N	M	T	L	E	S	E	I	A	N	Y	Q	Y	R	V	G	P	G	D	V	L	N	V	T	V	W	D	H	P	E	L	T	T	P	A	G	Q	Y	R	S	S	S	D	T	G	N	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	P	D	G	T	M	F	Y	P	Y	I	G	K	V	H	V	V	G	K	T	L	A	E	I	R	S	D	I	T	G	R	L	A	T	Y	I	A	D	P	Q	V	D	V	N	I	A	A	F	R	S	Q	K	A	Y	I	S	G	Q	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?																															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	S	G	Q	Q	A	I	T	N	V	P	L	T	I	L	D	A	I	N	A	A	G	G	L	T	D	T	A	D	W	R	N	V	V	L	T	H	N	G	R	E	E	R	I	S	L	Q	A	L	M	Q	N	G	D	L	N	Q	N	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?												?		?																									?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	Y	P	G	D	I	L	Y	V	P	R	N	D	D	L	K	V	F	V	M	G	E	V	K	K	Q	S	T	L	K	M	D	F	S	G	M	T	L	T	E	A	L	G	N	A	E	G	I	D	M	T	T	S	N	A	S	G	I	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?		?											?	?				?	?															?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	R	P	L	K	G	E	G	G	R	N	G	K	I	A	N	I	Y	Q	L	D	M	S	D	A	T	S	L	V	M	A	T	E	F	R	L	Q	P	Y	D	V	V	Y	V	T	T	A	P	V	S	R	W	N	R	L	I	N	Q	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	T	I	S	G	V	R	Y	M	T	D	T	A	S	D	I	H	N	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand